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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002879`

染色体: Chr01 坐标: 47394962-47396196 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002879`
名称	SmilChr01G002879
描述	FCS-Like Zinc finger 14-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47394962 - 47396196 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987864`
GeneID	`130987864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987864`
原始查询	`SmilChr01G002879`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FCS-Like Zinc finger 14-like
产物	FCS-Like Zinc finger 14-like
Arabidopsis	`AT5G20700` (AT5G20700) senescence-associated family protein, putative (DUF581) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832193] identity=38.6; qcov=0.875; evalue=3.06e-30; confidence=medium
Rice	`Os02g0174800` - identity=32.2; qcov=0.879; evalue=6.03e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04570 (zf-FLZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767556.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057767556.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767556.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767556.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47395141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C17,C26,D1
`Chr1:47395145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C64,C66
`Chr1:47395225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr1:47395399`	`GTA`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A5,B81
`Chr1:47395412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:47395414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B54,B94,C42,C71
`Chr1:47395438`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C27
`Chr1:47395438`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C27
`Chr1:47395443`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C27
`Chr1:47395443`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C27
`Chr1:47395516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:47395533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767556.1

240 aa

120

240

zf-FLZ

PF04570 zf-FLZ 159-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767556.1`	Pfam	`PF04570`	zf-FLZ	Domain	159	206	3.9e-23	81.4	zinc-finger of the FCS-type, C2-C2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911573.1
GGTTCAATAATTCAGCCTTAGTGATTGTGTTCCAAGAGAAAATATTCAAAAAATATAGTAAAAATTAATCATGCAATTAGTATATAACTCCGCATTTCAAACCAAACCATGGGCTTAGTCTAACAACTCCATCAATCGAACAATCACAATTGAGGAAGCTCCATAAAAAGGGAGAGCTCAAGAGCAAGCCTCCAAAACTCTCCCTCCATCAAATTAATCATATCATTTAATCGGAGAATATTATTTCTAGTCATGTTAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987864
ATGTTAGGGAAGACGTCGAAGCCGGTGATCGAGATTCTCACCGGATCTTTGTGTTCCGGCGCCGGAAGCCCGAGGAGTCAGATTCAGTCTCCGAGGGGGCTCAAGAGCCTGGATCTCGGCGCCGTGGGGTTAGGGATAGTGGCGGCTCTCGAGAAATCCGGCGCTGGTAGGGATGGTATTCCGGCGTTGTTCGGCCGGAATTTGACGCGATCGAGTCCGATTCCGGTGAATTCTCCGAAGAATTGTTGTAGGAGTAGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767556.1
MLGKTSKPVIEILTGSLCSGAGSPRSQIQSPRGLKSLDLGAVGLGIVAALEKSGAGRDGIPALFGRNLTRSSPIPVNSPKNCCRSRREAEEMQMDSLEEYTIVTCHGPNKSYTKVYSDAAAEGGRKGDERAPFRIQNGKKSNRAAVFHISPARGVDTGGVPTPDFLSSCDLCQKKLHGKDIYMYRGEKAFCSADCRYTQMVMDERKEKCSAEASKPAAAAEVAGSPYGNGQMFTAGILAI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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