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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002911`

染色体: Chr01 坐标: 47832517-47834701 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002911`
名称	SmilChr01G002911
描述	NAC domain-containing protein JA2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47832517 - 47834701 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988107`
GeneID	`130988107`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988107`
原始查询	`SmilChr01G002911`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein JA2-like
产物	NAC domain-containing protein JA2-like
Arabidopsis	`AT1G77450` (NAC032) NAC domain containing protein 32 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844081] identity=33; qcov=0.869; evalue=1.34e-19; confidence=low
Rice	`Os01g0816100` (OsNAC4) - identity=30.6; qcov=0.97; evalue=2.65e-19; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988107

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767853.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767853.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767853.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767853.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767853.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47833153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B105,B65,C18,C78
`Chr1:47833366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B87
`Chr1:47834452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B26,B75,C26
`Chr1:47834506`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A1,A11,A13,B105,B115,B12,B13,B134,B14,B140,B22,B27,B32,B33,B4,B46,B50,B55,B6,B64,B67,B71,B73,B88,B95,B97,C11,C17,C24,C25,C26,C34,C36,C40,C41,C46,C48,C56,C68,C69,C73,C8,C84,D10,D9
`Chr1:47834539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,C14,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767853.1

199 aa

100

199

NAM

PF02365 NAM 31-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767853.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	31	165	2.6e-23	83.5	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911870.1
TCTCAGTCACGCTCAAATTAATTGAATCGTCATGGCCGTACTTCCGAAGATGGATTGCCGTTTTACGTCTGCAAAGGTAGGCGTCGATGTCGATGGCAACGGAGATTCAATAATGGAGGTTCCGATGGGGTGGCGGTTTATGCCGACCGACGAAGAACTTATCATATCGTATTTGTCCAGAAAAGTGGCTTTCAGATCTCTACCAGCTCAGATTATTAAGGAGATTGATGCAACCGAGTTTTATAAACACCATCCAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988107
ATGGCCGTACTTCCGAAGATGGATTGCCGTTTTACGTCTGCAAAGGTAGGCGTCGATGTCGATGGCAACGGAGATTCAATAATGGAGGTTCCGATGGGGTGGCGGTTTATGCCGACCGACGAAGAACTTATCATATCGTATTTGTCCAGAAAAGTGGCTTTCAGATCTCTACCAGCTCAGATTATTAAGGAGATTGATGCAACCGAGTTTTATAAACACCATCCAAACAATCTTGTTGATAATGTTTGCTTCAAGAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767853.1
MAVLPKMDCRFTSAKVGVDVDGNGDSIMEVPMGWRFMPTDEELIISYLSRKVAFRSLPAQIIKEIDATEFYKHHPNNLVDNVCFKRDLCSLETECYLFINHDQYFHGRIIKMRQVGEGNIGFWRCDGKEEAIFDAHGNVFAYKLHSTFYNSKSKKTSWKMEEYRLVHRYFNKDENSPRDEWVVARIRGAQSLQQKLEFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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