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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002913`

染色体: Chr01 坐标: 47859232-47864317 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002913`
名称	SmilChr01G002913
描述	cell division control protein 6 homolog B-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47859232 - 47864317 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988132`
GeneID	`130988132`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988132`
原始查询	`SmilChr01G002913`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cell division control protein 6 homolog B-like
产物	cell division control protein 6 homolog B-like
Arabidopsis	`AT1G07270` (AT1G07270) Cell division control, Cdc6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837238] identity=58.9; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0856000` (OsCDC6) - identity=58.3; qcov=0.87; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003688 (DNA replication origin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006270 (DNA replication initiation); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0033314 (mitotic DNA replication checkpoint signaling); GO:0051301 (cell division)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF09079 (WHD_Cdc6); PF13401 (AAA_22); PF17872 (AAA_lid_10); PF22606 (Cdc6-ORC-like_ATPase_lid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988132

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767891.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057767891.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057767891.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057767891.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47859773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B98,C48
`Chr1:47860764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B131,B46,B82,C48
`Chr1:47860776`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A15,A25,B1,B10,B101,B11,B115,B2,B20,B27,B40,B5,B91,B94,C2,C25,C27,C32,C55,C57,C62,C64,C66,C68,C71,C80
`Chr1:47861081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B44,B66,C5
`Chr1:47861705`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	27	B129,B130,B139,B34,B37,B42,B60,B64,B78,B79,B8,B80,B82,C10,C12,C21,C3,C31,C40,C59,C64,C71,C76,C8,C85,D11,D9
`Chr1:47862599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B57
`Chr1:47862798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:47862888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B57,C39
`Chr1:47863021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:47863427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:47863452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:47863517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B131,B46,B82,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767891.1

499 aa

250

499

AAA_22

AAA

Cdc6-ORC-like_ATPase_lid

AAA_lid_10

WHD_Cdc6

PF13401 AAA_22 138-254 aa PF00004 AAA 143-275 aa PF22606 Cdc6-ORC-like_ATPase_lid 295-349 aa PF17872 AAA_lid_10 317-349 aa PF09079 WHD_Cdc6 396-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767891.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	138	254	4e-12	47.3	AAA domain
`XP_057767891.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	143	275	0.00015	22.9	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057767891.1`	Pfam	`PF22606`	Cdc6-ORC-like_ATPase_lid	Domain	295	349	5.5e-11	42.9	Cdc6/ORC-like, ATPase lid domain
`XP_057767891.1`	Pfam	`PF17872`	AAA_lid_10	Domain	317	349	5.7e-06	27.1	AAA lid domain
`XP_057767891.1`	Pfam	`PF09079`	WHD_Cdc6	Domain	396	487	5.1e-23	81.6	CDC6, C terminal winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911908.1
GCTGCACTCTCAATTTCTTCAACCTTTTCCCACTTTTACAGCTTCAGGTAGCAATCCCAAAACAGATATGCCCGCCTTCGTAGCTCGCCGTCAATCTCCGTCGTCAGATCCGGCCTCTGAGACCAGAGTTGCCGTTACTCCTAGGAAGAACCGTCTGAGATCCGAGTCGGATGCTGCAATCGGATCGCCGCTGCGTAAATCTCCTCGGTTGTGCAAAGAAGACAGCCCTAATAGTTCCCCGAAGATTGATGTAATCCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988132
ATGCCCGCCTTCGTAGCTCGCCGTCAATCTCCGTCGTCAGATCCGGCCTCTGAGACCAGAGTTGCCGTTACTCCTAGGAAGAACCGTCTGAGATCCGAGTCGGATGCTGCAATCGGATCGCCGCTGCGTAAATCTCCTCGGTTGTGCAAAGAAGACAGCCCTAATAGTTCCCCGAAGATTGATGTAATCCGAAAATGCCTGAAATCATCATTGCATTTGGGTGGATCGCCTCAGAAGAAGCGATTATCTGAGGATTTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767891.1
MPAFVARRQSPSSDPASETRVAVTPRKNRLRSESDAAIGSPLRKSPRLCKEDSPNSSPKIDVIRKCLKSSLHLGGSPQKKRLSEDFVERQTWDPREETQLRAVNEALHVSTAPMNVVCRENEQSRILDFCKKCVKEEKAGSLYVCGCPGTGKTLSMEKVKKMLVEWANGEGVQPPDILSINCTSLANMNEIFSKIREQNHSGKKSSCSTSSLQQIQNLYSQQTPGMKMILVIADELDYLITKDRAVLHDLFMLTTMPFSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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