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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002918`

染色体: Chr01 坐标: 47901901-47904724 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002918`
名称	SmilChr01G002918
描述	DNA repair protein RAD51 homolog
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47901901 - 47904724 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988172`
GeneID	`130988172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988172`
原始查询	`SmilChr01G002918`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA repair protein RAD51 homolog
产物	DNA repair protein RAD51 homolog
Arabidopsis	`AT5G20850` (RAD51) RAS associated with diabetes protein 51 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832208] identity=88.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0615800` (RAD51A1) - identity=91.3; qcov=0.93; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000150 (DNA strand exchange activity); GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0000730 (DNA recombinase assembly); GO:0000794 (condensed nuclear chromosome); GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006312 (mitotic recombination); GO:0007131 (reciprocal meiotic recombination); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0042148 (DNA strand invasion); GO:0070192 (chromosome organization involved in meiotic cell cycle); GO:0140664 (ATP-dependent DNA damage sensor activity); GO:1990426 (mitotic recombination-dependent replication fork processing)
KEGG	smil03440 (Homologous recombination - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00154 (RecA_N); PF08423 (Rad51); PF13481 (AAA_25); PF14520 (HHH_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057767940.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767940.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057767940.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057767940.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47902583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:47904532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767940.1

345 aa

172

345

HHH_5

RecA_N

AAA_25

Rad51

PF14520 HHH_5 43-85 aa PF00154 RecA_N 93-311 aa PF13481 AAA_25 96-273 aa PF08423 Rad51 101-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767940.1`	Pfam	`PF14520`	HHH_5	Domain	43	85	7.5e-06	27.0	SAM-like Helix-hairpin-helix tandem
`XP_057767940.1`	Pfam	`PF00154`	RecA_N	Domain	93	311	1.3e-10	41.9	RecA N-terminal domain
`XP_057767940.1`	Pfam	`PF13481`	AAA_25	Domain	96	273	7.1e-09	36.3	AAA domain
`XP_057767940.1`	Pfam	`PF08423`	Rad51	Domain	101	343	1.2e-129	431.5	Rad51

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911957.1
AATTTATCCTCTTCTTTTCGCGCCTTCCCAAACCTATTCAAATACACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACAACACAAAAGAGACGCGCTCGTTTTCGGAGGTGGATGTCATTGATGGATCAGCAGGGAAGGAACAGGCCTTTGGTGCAAGAACAACCAGAGGAATCGGAAGATATTCAGCACGGCCCTTTCCCTGTTGAACAACTTCAGGCATCCGGAATTGCTGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988172
ATGTCATTGATGGATCAGCAGGGAAGGAACAGGCCTTTGGTGCAAGAACAACCAGAGGAATCGGAAGATATTCAGCACGGCCCTTTCCCTGTTGAACAACTTCAGGCATCCGGAATTGCTGCTATCGACATCAAAAAGCTCAAAGATGCAGGGTTGTGCACTGTGGAATCAGTGGCATACTCTCCAAGGAAAGAGCTTCTGCAAATAAAAGGAATTAGTGATGCAAAAGTTGATAAGATCATTGAGGCAGCTTCGAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767940.1
MSLMDQQGRNRPLVQEQPEESEDIQHGPFPVEQLQASGIAAIDIKKLKDAGLCTVESVAYSPRKELLQIKGISDAKVDKIIEAASKLVPLGFTSATQLHAQRLEIIQITSGSKELDKILEGGVETGSITELYGEFRSGKTQLCHTLCVTCQLPLDQGGGEGKAMYIDAEGTFRPQRLLQIADRFGLNGADVLENVAYARAYNTDHQSRLLLEAASMMVETRFALMIVDSATALYRTDFSGRGELSARQMHLAKFLRSLQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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