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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002926`

染色体: Chr01 坐标: 48031055-48031829 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002926`
名称	SmilChr01G002926
描述	cortical cell-delineating protein-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48031055 - 48031829 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988226`
GeneID	`130988226`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988226`
原始查询	`SmilChr01G002926`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cortical cell-delineating protein-like
产物	cortical cell-delineating protein-like
Arabidopsis	`AT4G12520` (AT4G12520) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826864] identity=51.2; qcov=0.583; evalue=1.09e-27; confidence=medium
Rice	`Os03g0103100` (OsHyPRP03) - identity=52.9; qcov=0.59; evalue=6.23e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2); PF14547 (Hydrophob_seed)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988226

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057767997.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057767997.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767997.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767997.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767997.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48031119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B26,B89,C11,C69
`Chr1:48031126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B50,B88,C11,C69
`Chr1:48031182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B129,C25
`Chr1:48031199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C48
`Chr1:48031212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C11
`Chr1:48031227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A4,B49,C39
`Chr1:48031228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C5
`Chr1:48031247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A4,B49,C39
`Chr1:48031252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:48031269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A24,B104
`Chr1:48031321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C5
`Chr1:48031344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767997.1

144 aa

144

LTP_2

Hydrophob_seed

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 58-143 aa PF14547 Hydrophob_seed 60-143 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 61-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767997.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	58	143	8.9e-09	36.1	Probable lipid transfer
`XP_057767997.1`	Pfam	`PF14547`	Hydrophob_seed	Domain	60	143	5.1e-23	81.9	Hydrophobic seed protein
`XP_057767997.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	61	143	1.3e-14	54.9	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912014.1
GTCTGCACGAAATTAAAAATCTTGAAAAACGAAATTAAAGGAAAACAAAAGTTGTATAGAATATGGCTTCACCGAAAGCCCATAATATTCTTCTCTCCCTCAACCTTGTCTACTTGGTCCTATCCGCCGCCGCCGCCACCACCACTAGAGGCAGCGGCTCGGCAATGGCCCCCGGGCCTGCGATGCCTCCCGGGCTCGCGATGCCCCCTGGCCTCACGATGCACCCCCGGCCGATGCGAAGGTGCCCGAGAGACGCCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988226
ATGGCTTCACCGAAAGCCCATAATATTCTTCTCTCCCTCAACCTTGTCTACTTGGTCCTATCCGCCGCCGCCGCCACCACCACTAGAGGCAGCGGCTCGGCAATGGCCCCCGGGCCTGCGATGCCTCCCGGGCTCGCGATGCCCCCTGGCCTCACGATGCACCCCCGGCCGATGCGAAGGTGCCCGAGAGACGCCCTAAAGCTACGTGCATGTGCAAAAGTGATGGGGAATATGGTGGGAATGTGGAGTGGGAAACCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767997.1
MASPKAHNILLSLNLVYLVLSAAAATTTRGSGSAMAPGPAMPPGLAMPPGLTMHPRPMRRCPRDALKLRACAKVMGNMVGMWSGKPPTRQCCSLLAGMVELEAAACLCTTIRAHMFGMKFNIPLAFSLLLNVCGTTPPTDFTCY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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