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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002929`

染色体: Chr01 坐标: 48061372-48064142 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002929`
名称	SmilChr01G002929
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48061372 - 48064142 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988242`
GeneID	`130988242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988242`
原始查询	`SmilChr01G002929`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 4
产物	leucine-rich repeat extensin-like protein 4
Arabidopsis	`AT1G62440` (LRX2) leucine-rich repeat/extensin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842542] identity=71.9; qcov=0.454; evalue=8.53e-177; confidence=medium
Rice	`Os02g0138000` - identity=62.7; qcov=0.467; evalue=6.69e-142; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057768019.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057768019.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768019.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768019.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768019.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48061807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B47,B9,C56
`Chr1:48061807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B9,C56
`Chr1:48061825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B3
`Chr1:48061847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:48061899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B114,C11,D8
`Chr1:48061944`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B105,B115,C2,C56
`Chr1:48061944`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B105,B115,C2,C56
`Chr1:48061964`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B100,B115,C58,C9,D9
`Chr1:48061964`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B100,B115,C58,C9,D9
`Chr1:48062047`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr1:48062047`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D4
`Chr1:48062156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768019.1

735 aa

368

735

LRRNT_2

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 65-97 aa PF13855 LRR_8 133-191 aa PF00560 LRR_1 299-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768019.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	65	97	2e-05	25.5	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057768019.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	133	191	3.3e-16	59.5	Leucine rich repeat
`XP_057768019.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	299	321	1e-14	52.2	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912036.1
TAGTGAGAAATAAAAGTTAAAAAACAATAAAATTATAATGATAAAAAATGAAAGTGAGGAGAGAATAAATTGAGGCAGCAGGTGGTAGCTTATTCATTCAATACATTATTATTATTTTGTCAGCTGAAAGCACTCCTCTCTGTTCCCTTTTAATGTGCGCTAATAATCCATCCCTTACCTCATTGAATCTCCCTCTCCTCTCATGAATCCCTCCGCCACCACCTCGCGGCGGCGCCGCCCCTCCTTATTGCTCTTCACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988242
ATGAATCCCTCCGCCACCACCTCGCGGCGGCGCCGCCCCTCCTTATTGCTCTTCACAGCCCTCACTATCGCCCTCGTCGCCTCGCAGATCCCCAATGTGGCCGCCGGGGAGAACGACATCAACTTAAAAGACATCGTTCGCGATGCCAGAAACTTGACCTTCGAGAACCCTAGCCTCCGCCGCGCCTACTACGCGTTACAAGCGTGGAAGCAAGCCATTTTCTCCGATCCGTCCAACTTCACCGCCAACTGGACCGGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768019.1
MNPSATTSRRRRPSLLLFTALTIALVASQIPNVAAGENDINLKDIVRDARNLTFENPSLRRAYYALQAWKQAIFSDPSNFTANWTGADVCSYGGVFCAPSPSNASMRVVAGIDLNHGDIAGYLPDELGLLTDLALFHINSNRFCGLVPDTFKKLKLLFELDLSNNRFVGGFPKVVLSLPSLKFLDLRFNDFEGGVPTQVFDKDLDALFLNDNRFRFGIPDNLGNSPVSVMVLANNNLGGCIPASIGKMGKTLNELILMND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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