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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002932`

染色体: Chr01 坐标: 48093950-48097012 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002932`
名称	SmilChr01G002932
描述	organic cation/carnitine transporter 7-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48093950 - 48097012 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988256`
GeneID	`130988256`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988256`
原始查询	`SmilChr01G002932`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organic cation/carnitine transporter 7-like
产物	organic cation/carnitine transporter 7-like
Arabidopsis	`AT3G13050` (NiaP) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820491] identity=53; qcov=0.998; evalue=2.43e-165; confidence=high
Rice	`Os09g0559800` - identity=54.4; qcov=0.992; evalue=1.12e-175; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00083 (Sugar_tr); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988256

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057768044.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057768044.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768044.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768044.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768044.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48094362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B37,C13,C21,C22
`Chr1:48094405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:48095031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:48095149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:48095227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B57
`Chr1:48095639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B40,C2
`Chr1:48095701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:48095718`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B66
`Chr1:48095718`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B66
`Chr1:48095924`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A1,B115,B119,C50
`Chr1:48095924`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A1,B115,B119,C50
`Chr1:48096092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,C19,C41,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768044.1

486 aa

243

486

MFS_1

Sugar_tr

PF07690 MFS_1 39-436 aa PF00083 Sugar_tr 65-482 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768044.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	39	436	3.1e-38	132.3	Major Facilitator Superfamily
`XP_057768044.1`	Pfam	`PF00083`	Sugar_tr	Family	65	482	1.4e-44	153.5	Sugar (and other) transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912061.1
GAGTAAACCCAACCCGGAAAATGACGTACACGTATTCACAAGCATACCCGTTTAAGAATCGAGCCAATTTGGATCAATCAGGCTGAGCCAGAGCCCATCATGAATACTCAGGTGGTGGATATTGATGGGAGTGGTCCAGCTTACACTCTGGATGAAGCTCTTGGCGCGGTTGGGTTTGGGAAATTCCAAGCTCTGGTGCTGGCTTATGCCGGGCTTGGAGCCATGTCTGAAGCAATGGAGGTGATGATACTGTCTTTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988256
ATGAATACTCAGGTGGTGGATATTGATGGGAGTGGTCCAGCTTACACTCTGGATGAAGCTCTTGGCGCGGTTGGGTTTGGGAAATTCCAAGCTCTGGTGCTGGCTTATGCCGGGCTTGGAGCCATGTCTGAAGCAATGGAGGTGATGATACTGTCTTTTATTGGACCTTCAGTGAAAGCAGAATGGGGGCTTTCGTCGGGGCAAGAGAGCTTGATCACCACTATGGTCTTTGCCGGGATGCTCATTGGAGCTTATTTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768044.1
MNTQVVDIDGSGPAYTLDEALGAVGFGKFQALVLAYAGLGAMSEAMEVMILSFIGPSVKAEWGLSSGQESLITTMVFAGMLIGAYFWGILSDNYGRRVGLLSVAVVTSIFAFLSAVSPNYVLLILFRMVVGIGLGGGPVYSTWFLEFVPVRNRGIWMVIFSTFWTIGTILEAALAWIVIPRLGWRWLLAVSSVPCFAAFILYFLTIETPRYLYMHGKIGDAYEVLKKMATVNKTELPSGKLVYEKTSNLNEDFTPLEGTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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