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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002936`

染色体: Chr01 坐标: 48113298-48119428 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002936`
名称	SmilChr01G002936
描述	chloroplast envelope membrane protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48113298 - 48119428 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988304`
GeneID	`130988304`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988304`
原始查询	`SmilChr01G002936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloroplast envelope membrane protein
产物	chloroplast envelope membrane protein
Arabidopsis	`AT4G31040` (AT4G31040) CemA-like proton extrusion protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829231] identity=63.6; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0224300` (ARE1) - identity=58.6; qcov=0.926; evalue=3.58e-156; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03040 (CemA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988304

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768102.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057768102.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057768102.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057768102.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768102.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48113915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:48114170`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr1:48114170`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr1:48114172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:48114217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B130,B4
`Chr1:48114283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:48114371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B3
`Chr1:48115612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B32,B65,D11
`Chr1:48116986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B57
`Chr1:48118201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:48118210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B22,B41
`Chr1:48119137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768102.1

433 aa

216

433

CemA

PF03040 CemA 202-431 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768102.1`	Pfam	`PF03040`	CemA	Family	202	431	2.8e-76	257.2	CemA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912119.1
ATGATAGAAAAGCGTATGGATACCTGAATATCATACATGCGGAAATATCCTGTATTGAGCTGAGGCTCTTATCCTTGATACGTAGGTTCATAAGGAATTCAGCTTCTACCGAAATAAAAATGAAAATGTAAGGCTCAAATTCCAGTTTAGTACCTAAAATGTGCCATAAATCACAACAATCACCATAACCTCGAAGCTTATTTTTGACGGGTAAACTGGGCAGGTGTCAAGAGGTTTATCTGAAGAGAAAATCAAACCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988304
ATGTTCTTGATGAGCACTTCAATTGTCCTATGTCAAAATCTGATATTGTCTAAGAATAGTTGTGTTTTTGAGAGTTCGTTTCGGTGGGGCAATGCTTGGAGTTCTGGGGTTCAGTTGAGTCGTCGGAGGAGTTGTGGGCTGGTGCCAAATGCCAAGAAAAGGCATGCAAAGAAGAGGAGTTGGTGGCAGAAGTTCTTCTTTGATGAGGATGGGAATTGGCTTGGTTTGAAGGATGAGGATGCATTCGAAGTGCTTGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768102.1
MFLMSTSIVLCQNLILSKNSCVFESSFRWGNAWSSGVQLSRRRSCGLVPNAKKRHAKKRSWWQKFFFDEDGNWLGLKDEDAFEVLEEEEEEPSDVGLSANEKFEAWRRRAEAIVELREAQEDVKNEENRRWEDWIVDGTYDVDVSNGASWVQDSNGAVGKPGDDVEEDFREVFSGRGLAKSVRDLVLGREDDDILYEDRVFRYASFNSAKFLAVLVIVPWAVDFVVHDYILMPFLDRYVEKVPLAAQVLDVRRNQKLEMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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