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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002938`

染色体: Chr01 坐标: 48158370-48164782 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002938`
名称	SmilChr01G002938
描述	YTH domain-containing protein ECT1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48158370 - 48164782 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988321`
GeneID	`130988321`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988321`
原始查询	`SmilChr01G002938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	YTH domain-containing protein ECT1
产物	YTH domain-containing protein ECT1
Arabidopsis	`AT3G13060` (ECT5) evolutionarily conserved C-terminal region 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820492] identity=47.1; qcov=0.923; evalue=1.57e-146; confidence=high
Rice	`Os08g0556000` - identity=41.2; qcov=0.997; evalue=5.04e-140; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0061157 (mRNA destabilization)
KEGG	-
Pfam	PF04146 (YTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988321

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768124.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057768124.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057768124.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057768124.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057768124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48158728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:48158742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:48159922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B106,C58
`Chr1:48160027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B106,B37,B48,B63,B73,B89
`Chr1:48160745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:48162224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:48162264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:48162375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:48162440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B134,B23,B30,C53
`Chr1:48163181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:48164062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr1:48164077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768124.1

608 aa

304

608

YTH

PF04146 YTH 399-537 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768124.1`	Pfam	`PF04146`	YTH	Domain	399	537	5.1e-49	166.2	YT521-B-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912141.1
AAGCGGTACCGAAAATGAAGCCAAATTTATTTATGTATGCATGCATATTTTGTAAGTATATATGTCTCTCTAAAACCCTTTCGTGTCTGTTTGTTTTCAAACCCTCCCGCGAAGCAATTTTTCGCATTTTCTAGATGCCCTCGTAAAATTGAGAGCGAATTCCAATTGTTTGTGAAAGGAGAGGGCTTTTCTCGCATACACACTTATATACTCGATTCAAGTAATTCGATTGGTTTAATTGGATCTTCAACTGAGTGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988321
ATGGAAGACGGTAATCAGCCGAGCCTCGATCGCTTCGCCCCCATTCAGTCCCCTGGTGACCGAGCTGTTGAGATACATACTTTGCCTGAACAGCATCCCTCACCAAAAGGTGAAAGGATTGTTTCTACAAATCCTTCTCCAGATACTGCCATTTCGGGTGCCTCAAGAACCACCAAAGATCAGCCAGCAACTTCAGAACCAAGTGGAACTCTTTCTGCAGTGCATCCATATAATGCATATACCCCTCAAGAACAGGGTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768124.1
MEDGNQPSLDRFAPIQSPGDRAVEIHTLPEQHPSPKGERIVSTNPSPDTAISGASRTTKDQPATSEPSGTLSAVHPYNAYTPQEQGYYFGGYENGSGNWDEHSNYVNANNLHVIPPGMYNDNSSLFFPPSYGFDSQMAYGQFSPLASPMSSIMIDGQLFSPHQMPVTPPYYPPAVSPGPPHATSGLPASQTELMPSGNSSQENLIDNAFFGPGSYYLPFGSFGGGDISGNSGHGLYNFPGEFASNEPMPSRSSSLDSSRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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