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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002955`

染色体: Chr01 坐标: 48417621-48421261 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002955`
名称	SmilChr01G002955
描述	U-box domain-containing protein 52-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48417621 - 48421261 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988486`
GeneID	`130988486`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988486`
原始查询	`SmilChr01G002955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 52-like
产物	U-box domain-containing protein 52-like
Arabidopsis	`AT2G24370` (AT2G24370) kinase with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816973] identity=64.5; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0787200` (OsRLCK87) - identity=60.6; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00582 (Usp); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988486

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768338.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057768338.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768338.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768338.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48418199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:48418434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr1:48418517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B26,C33
`Chr1:48418847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B27
`Chr1:48418921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C18
`Chr1:48418931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B84
`Chr1:48418952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr1:48419060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B26,C33
`Chr1:48419509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:48419812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B109,B129
`Chr1:48420220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:48420850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768338.1

718 aa

359

718

Usp

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00582 Usp 14-125 aa PF00069 Pkinase 441-693 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 443-698 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768338.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	14	125	1e-11	46.3	Universal stress protein family
`XP_057768338.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	441	693	1.6e-39	136.6	Protein kinase domain
`XP_057768338.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	443	698	2.2e-38	132.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912355.1
CATTTGAGTCAATGAATCTGAAACAGGATTCATTGTCTCAAACCAATTCAAAACTTTTCCCAGGAGAGAGATCTTGAGGGACTAAACATTTTTGCCTTTTGTGATATATCCACTCTCTGCTTTGGCTAATCCATTCAAATAAAAAATAATTGAAAAATGACAAGCCAAAGAGGGAATGGAGAGAAGAAGCAAGAGACGATTGCAGTAGCCATAGACAAGGACAAAGGGAGCCAAGCTGCATTGAAATGGGCTGTCGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988486
ATGACAAGCCAAAGAGGGAATGGAGAGAAGAAGCAAGAGACGATTGCAGTAGCCATAGACAAGGACAAAGGGAGCCAAGCTGCATTGAAATGGGCTGTCGATCATCTCTTGGGCAGAGGCAAAAGTGTTACCCTTCTTCATGTCAAACTCAAGAACTCTTTTCCACTGGGAGCTCGAATGGGTTTCCCTGACAACGACAACGCCAAAGAACTCTTCCTCCCCTTCCGCTGCTTCTGCACCCGCAAAGATATTCAAGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768338.1
MTSQRGNGEKKQETIAVAIDKDKGSQAALKWAVDHLLGRGKSVTLLHVKLKNSFPLGARMGFPDNDNAKELFLPFRCFCTRKDIQVHEVILEDSDVAKAVCEYVKNNSIETLVIGSSPKNGFVRFKTVDIPGSVNKMAPDYCTVYVISKGKVASCRSPSIPAQRERSLHNSGSLHDARYAQLNGGRSSPAAPYAKPSMEETDSIRSPFTRGKANKSYGELSMGESDISFVGSARPSSDRMMSPFDQDAFMAARLSSSSDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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