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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002958`

染色体: Chr01 坐标: 48451870-48455831 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002958`
名称	SmilChr01G002958
描述	proteasome subunit beta type-6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48451870 - 48455831 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988520`
GeneID	`130988520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988520`
原始查询	`SmilChr01G002958`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteasome subunit beta type-6
产物	proteasome subunit beta type-6
Arabidopsis	`AT4G31300` (PBA1) N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829257] identity=85.5; qcov=0.966; evalue=3.32e-149; confidence=high
Rice	`Os02g0770000` (OsPBA1) - identity=80; qcov=0.975; evalue=3.06e-141; confidence=high
GO	GO:0004298 (threonine-type endopeptidase activity); GO:0005839 (proteasome core complex); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00227 (Proteasome)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768382.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768382.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057768382.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768389.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768389.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48452314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B66,B68,B84,D7
`Chr1:48452320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:48453566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:48454317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C28,C85
`Chr1:48454354`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B55
`Chr1:48455270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	82	A11,A13,A14,A21,A22,A23,A3,A4,B10,B105,B107,B110,B111,B12,B125,B134,B136,B138,B14,B16,B24,B26,B3,B31,B34,B4,B40,B42,B43,B52,B54,B55,B57,B58,B6,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B76,B77,B8,B81,B83,B84,B85,B9,B90,B91,B92,B93,C16,C17,C21,C22,C24,C25,C26,C29,C34,C36,C43,C44,C49,C51,C54,C55,C57,C59,C60,C70,C77,C8,C82,C85,C86,C87,C9,D2,D7
`Chr1:48455547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C28
`Chr1:48455646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr1:48455650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B109,B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768382.1

247 aa

124

247

Proteasome

PF00227 Proteasome 14-193 aa

XP_057768389.1

236 aa

118

236

Proteasome

PF00227 Proteasome 14-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768382.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	14	193	3.4e-50	171.1	Proteasome subunit
`XP_057768389.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	14	194	2.6e-50	171.4	Proteasome subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912406.1
AACAGCTTTCGCGAACACTCATTTCAGTTGGGGAACAATTAGTGGATTTGAGCCCAATTTGATTTCGGGTAATTGTTTTGGGTAAGCACGAAAGACGAACCAATTATCTTCAAAAACTGGGTCAATTCGTAATATTTTGCTTTTAATTAATTAGGGGCCAATCAATAATTCTTACAAGTTTAGGGGTCAAACCTATATTGTTGCACACTGCAACAAAAGCTTCTTCAGCTGCACGAAACTCCCTATTTATTGTTTTTCTA...

XM_057912399.1
GTTGCACACTGCAACAAAAGCTTCTTCAGCTGCACGAAACTCCCTATTTATTGTTTTTCTACATTTTCCCCAATTCTCCCCCCAACAAATTATTATCTGCTGTTAATTCCTCCAGTTCGCACATATTCCAATCGATCTTCAGTCATGGACTCAATTTACAACGATCTGAACGCCCCGCACTCGATGGGAACCACCATCATCGGCGTCACATACGACGGCGGCGTTGTTTTGGGCGCCGACTCTCGGACCAGCACCGGAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988520
ATGGACTCAATTTACAACGATCTGAACGCCCCGCACTCGATGGGAACCACCATCATCGGCGTCACATACGACGGCGGCGTTGTTTTGGGCGCCGACTCTCGGACCAGCACCGGAATGTATGTGGCGAATAGGGCATCTGATAAGATCACTCAGTTGACCGACAATGTCTACATTTGCCGCTCTGGTTCGGCTGCAGATTCTCAGGTTCTTTCAGATTATGTTCGCTACTACCTCCATCAACACACGATACAGCTTGGGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768382.1
MDSIYNDLNAPHSMGTTIIGVTYDGGVVLGADSRTSTGMYVANRASDKITQLTDNVYICRSGSAADSQVLSDYVRYYLHQHTIQLGQPATVKVAANLVRMVSYNNKNMLQTGLIVGGWDKYEGGKIYGIPLGGTLLEQPFTIGGSGSSYLYGFFDQVWKEGMTQDEAEKLVVKAVSLAIARDGASGGVVRTVTVSTFLIMSYASWLDSDPPPFKLENGTSDVMCCLPHLYNMHSLNGQQLNSANEKF

XP_057768389.1
MDSIYNDLNAPHSMGTTIIGVTYDGGVVLGADSRTSTGMYVANRASDKITQLTDNVYICRSGSAADSQVLSDYVRYYLHQHTIQLGQPATVKVAANLVRMVSYNNKNMLQTGLIVGGWDKYEGGKIYGIPLGGTLLEQPFTIGGSGSSYLYGFFDQVWKEGMTQDEAEKLVVKAVSLAIARDGASGGVVRTVTINKDGVSRKFYPGDTLPLWHEELEAKDSLLDTLSAASPEPMVS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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