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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002961`

染色体: Chr01 坐标: 48506974-48507519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002961`
名称	SmilChr01G002961
描述	uncharacterized SmilChr01G002961
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48506974 - 48507519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009169`
GeneID	`131009169`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009169`
原始查询	`SmilChr01G002961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=31.5; qcov=0.718; evalue=8.34e-14; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.3; qcov=0.878; evalue=7.09e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009169

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792391.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792391.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057792391.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792391.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792391.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48506987`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	55	A11,A15,A18,A24,A5,A6,A8,B105,B107,B114,B118,B122,B126,B15,B26,B3,B31,B36,B38,B39,B42,B43,B47,B63,B65,B68,B70,B84,B85,B94,C14,C20,C21,C22,C3,C34,C39,C42,C43,C54,C6,C61,C70,C77,C78,C79,C80,C83,C85,C87,C9,D1,D3,D5,D9
`Chr1:48506996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B128,B93
`Chr1:48506997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:48507011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B131,B26,C77
`Chr1:48507017`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B74
`Chr1:48507017`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B74
`Chr1:48507018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B134,B67,C81,D4
`Chr1:48507029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B134,B67,C81,D4
`Chr1:48507041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B28,C11,C69
`Chr1:48507051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C55
`Chr1:48507052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A14,A5,B103,B58,C53,C60
`Chr1:48507100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A1,B129,B134,B2,B44,C12,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792391.1

181 aa

181

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 8-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792391.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	8	79	5e-17	63.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936408.1
ATGTCGAATCTTAGCGGAGTTCAAAAGGAGTTGGCTTTGATTTGGAAAGCACAAGTCCCTGCTAAAGTAATTGCTACAGCTTGGAAGGTCCTTAAAGGAAGAATCGCAACGGTGGACAATCTTCGGAGAAGACAAGCTGCGATGCACTTGGCGACTGATATGTGTGCCCTTTGTCAGCTGAAAGAAGAAACCATTGAGCATCTTTTCTTTCTCTGCCAAAAAACTGATGAAATCTGGAAAGAAGTCTTGAGTTGGACAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009169
ATGTCGAATCTTAGCGGAGTTCAAAAGGAGTTGGCTTTGATTTGGAAAGCACAAGTCCCTGCTAAAGTAATTGCTACAGCTTGGAAGGTCCTTAAAGGAAGAATCGCAACGGTGGACAATCTTCGGAGAAGACAAGCTGCGATGCACTTGGCGACTGATATGTGTGCCCTTTGTCAGCTGAAAGAAGAAACCATTGAGCATCTTTTCTTTCTCTGCCAAAAAACTGATGAAATCTGGAAAGAAGTCTTGAGTTGGACAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792391.1
MSNLSGVQKELALIWKAQVPAKVIATAWKVLKGRIATVDNLRRRQAAMHLATDMCALCQLKEETIEHLFFLCQKTDEIWKEVLSWTSKQAVLHCQTKAHFNAFVNLGSKKDVDFFLGVWVCVIWSIWKTRNNCIFNQGSWNKARMMAEIKARLWGWRSNSVQPTQEQEFRSWFTAARGFDT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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