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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002965`

染色体: Chr01 坐标: 48524866-48531757 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002965`
名称	SmilChr01G002965
描述	sodium transporter HKT1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48524866 - 48531757 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988611`
GeneID	`130988611`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988611`
原始查询	`SmilChr01G002965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sodium transporter HKT1-like
产物	sodium transporter HKT1-like
Arabidopsis	`AT4G10310` (HKT1) high-affinity K+ transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826623] identity=50.3; qcov=0.92; evalue=3.97e-153; confidence=high
Rice	`Os02g0175000` (HKT1;3) probable cation transporter HKT6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4328468] identity=47; qcov=0.994; evalue=1.97e-133; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006812 (monoatomic cation transport); GO:0008324 (monoatomic cation transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF02386 (TrkH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988611

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768485.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057768485.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057768485.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768485.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768485.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48525081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:48525119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:48525354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:48525394`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B10,B136,B138,B31,B54,B58,C51,C80,C9
`Chr1:48525449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C19,C40
`Chr1:48530811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B78
`Chr1:48530872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:48531276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B35,B73,C12,C41
`Chr1:48531369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C11,C51,C69
`Chr1:48531395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C41
`Chr1:48531438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:48531591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768485.1

499 aa

250

499

TrkH

PF02386 TrkH 56-358 aa PF02386 TrkH 390-486 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768485.1`	Pfam	`PF02386`	TrkH	Family	56	358	5.4e-40	138.0	Cation transport protein
`XP_057768485.1`	Pfam	`PF02386`	TrkH	Family	390	486	5.4e-40	138.0	Cation transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912502.1
TTTATACATACACTTAACTCCTCCATTTTTATGTCTGCAAATAAACCATTCACCACTAGAGAGAGAGAATGAAGAAACTCAAGTTAGGTGAGTGTAGTAAGAAAGTGAAGCATGCATCGTGCAGTTTGTGGGCGAAACTCGCACATTTCCTCCTCTTTCAACTCAACCCATTCTGGTTAGAACTCGGCTACTTCATCACACTCTCCTTATTCTGTTTCTTAACCCTAAAATCATCAAACACAAGAAGATCATCACCACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988611
ATGAAGAAACTCAAGTTAGGTGAGTGTAGTAAGAAAGTGAAGCATGCATCGTGCAGTTTGTGGGCGAAACTCGCACATTTCCTCCTCTTTCAACTCAACCCATTCTGGTTAGAACTCGGCTACTTCATCACACTCTCCTTATTCTGTTTCTTAACCCTAAAATCATCAAACACAAGAAGATCATCACCACCACCACCACTGCTGGATCTCTTCTTCACCTCCGTCTCCGCCGTCACCGTCTCGAGCATGTCCACTCTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768485.1
MKKLKLGECSKKVKHASCSLWAKLAHFLLFQLNPFWLELGYFITLSLFCFLTLKSSNTRRSSPPPPLLDLFFTSVSAVTVSSMSTLEMELFSSTQLLFLTFFMLAGGEVFTSLLQLHLTINKRKSLLTIDQQTQSIAIHQEEEEEAVYNSNKSLKILTYLITCYLVLLHALGSTLISIYLSLTPTAAKILKIKRINPQVFAIFTTVSTFANCGFVPTNENMIVFRNNSGLLLILIPLILMGNTLYPVFLRLAIWLSHKAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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