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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002976`

染色体: Chr01 坐标: 48692280-48694203 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002976`
名称	SmilChr01G002976
描述	xyloglucan endotransglucosylase protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48692280 - 48694203 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988734`
GeneID	`130988734`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988734`
原始查询	`SmilChr01G002976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xyloglucan endotransglucosylase protein 1-like
产物	xyloglucan endotransglucosylase protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G25810` (XTR6) xyloglucan endotransglycosylase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828686] identity=69.2; qcov=0.958; evalue=3.61e-140; confidence=high
Rice	`Os06g0697000` (OsXTH10) - identity=62.8; qcov=0.962; evalue=1.42e-131; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005618 (cell wall); GO:0010411 (xyloglucan metabolic process); GO:0016762 (xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity); GO:0042546 (cell wall biogenesis); GO:0048046 (apoplast)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00722 (Glyco_hydro_16); PF06955 (XET_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988734

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057768660.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057768660.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057768660.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768660.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768660.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48692755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:48692774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:48692885`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B53
`Chr1:48692885`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B53
`Chr1:48692923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:48692977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,B85
`Chr1:48693032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,D10
`Chr1:48693154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768660.1

288 aa

144

288

Glyco_hydro_16

XET_C

PF00722 Glyco_hydro_16 33-213 aa PF06955 XET_C 241-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768660.1`	Pfam	`PF00722`	Glyco_hydro_16	Domain	33	213	8e-67	224.8	Glycosyl hydrolases family 16
`XP_057768660.1`	Pfam	`PF06955`	XET_C	Family	241	285	1.7e-21	76.4	Xyloglucan endo-transglycosylase (XET) C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912677.1
CCCTTGAAAAAGGGAGCATCAAAAATTGTCTAGTATACTTATTTTGTCACATCTAAGTTCATCCCACACCTACACTAGTAAGTACCACTGCTCGGGAGAAAAGTATTGAAAATAGCATAATTTTAATAAACAGTACTAATCGATTCATTTGAATCATTTCAATGACAATAAATCTAAAAATACTACACAGATAGCTGTTTTTCAAGCAGCATCAAGAAATGGAAAATTTGTGTGTGTTGGCTAGTGATAGAATTCGAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988734
ATGATTCTTCAAGTTGCTTTACCTCAGATGAAGATGTTCCCTGTGCTTCTGCTGTTGCTAGCAGCCTTTGCTGGGGCTGTTCTTGCTGGTGGCAATTTCAACCAAGATTTCGACATCACGTGGGGCGAGGGCCAGGCGAAAATACTCGATAACGGGAAGCTTCTTACCCTTTCCTTGGACAAGGCTTCTGGTTCTGGATTTAGGTCCAAAAATCAGTACATGTTTGGGAAGATTGACATGCAGATCAAGCTCGTTGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768660.1
MILQVALPQMKMFPVLLLLLAAFAGAVLAGGNFNQDFDITWGEGQAKILDNGKLLTLSLDKASGSGFRSKNQYMFGKIDMQIKLVAGNSAGTVTTYYLSSLGSNHDEIDFEFLGNLTGDPYILHTNVFAQGQGNREQQFYLWFDPTKDFHTYSILWNPLGIIFSVDGTPIRQFKNHESKGISYPKNQPMWIFSSLWDAEDWATRGGLVKTDWTQAPFTASYTNFNALACTSPSGSCSKNSSANSWFSQSLDNPGIERIKW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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