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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002984`

染色体: Chr01 坐标: 48764304-48767196 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002984`
名称	SmilChr01G002984
描述	probable strigolactone esterase DAD2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48764304 - 48767196 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988816`
GeneID	`130988816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988816`
原始查询	`SmilChr01G002984`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable strigolactone esterase DAD2
产物	probable strigolactone esterase DAD2
Arabidopsis	`AT3G24420` (AT3G24420) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822032] identity=55.1; qcov=0.94; evalue=1.96e-110; confidence=high
Rice	`Os01g0595600` - identity=44.5; qcov=0.933; evalue=8.81e-79; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768768.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057768768.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057768768.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768768.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768768.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48764547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:48764549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr1:48764699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:48766720`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr1:48766720`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B106
`Chr1:48766935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,D10
`Chr1:48766946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:48766986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:48767057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768768.1

282 aa

141

282

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF12146 Hydrolase_4 31-258 aa PF00561 Abhydrolase_1 33-267 aa PF12697 Abhydrolase_6 34-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768768.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	31	258	4.4e-08	33.5	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057768768.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	33	267	4.9e-18	66.4	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057768768.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	34	273	2.5e-16	61.7	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912785.1
ACACTCTCATTTACCTTCACTTCTCTCTCTCATGGTCTCGCCTTCTCCAGAAACAAAAGGAACGATGGTGATGGGAGAGAATCTGGCGGCATCCATGAACGCCAAACTCGTGGGCTCAGGTAAGGAAACCGTAGTCCTCGCACACGGCTACGGCGGAGACCAGTCCGCCTGGGACAGGATAGTGCCCCTCCTCGCCGCCCGCCACCGCCTCCTCCTCTTCGATTGGTGCTTCTCCGGCGCCGTCAAGGATCCATCCCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988816
ATGGTCTCGCCTTCTCCAGAAACAAAAGGAACGATGGTGATGGGAGAGAATCTGGCGGCATCCATGAACGCCAAACTCGTGGGCTCAGGTAAGGAAACCGTAGTCCTCGCACACGGCTACGGCGGAGACCAGTCCGCCTGGGACAGGATAGTGCCCCTCCTCGCCGCCCGCCACCGCCTCCTCCTCTTCGATTGGTGCTTCTCCGGCGCCGTCAAGGATCCATCCCTCTACCACCCAAACAACTACTCCTCCTACGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768768.1
MVSPSPETKGTMVMGENLAASMNAKLVGSGKETVVLAHGYGGDQSAWDRIVPLLAARHRLLLFDWCFSGAVKDPSLYHPNNYSSYDAFADDLICVMEEMKVSGCVFVGHSMSGMIGCIASLKRPDLFTRLVLVGASPRYLNLIEEGYNGGFDLSDVEEMLSNIDSKYEQWAPAFASVVVDASDPLSVEKFANSLKRMNPQTALSLAKTVFLADYRYVLEKVVVPCNIIHTRNDVVVPLAAVEYMQNTIKAKAEVDIIDTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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