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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002986`

染色体: Chr01 坐标: 48792039-48792359 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002986`
名称	SmilChr01G002986
描述	uncharacterized SmilChr01G002986
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48792039 - 48792359 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009217`
GeneID	`131009217`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009217`
原始查询	`SmilChr01G002986`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=42.3; qcov=0.981; evalue=4.5e-16; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=48.1; qcov=1; evalue=2.4e-26; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009217

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057792460.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057792460.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792460.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792460.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792460.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48792058`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B126,B15,B44,B50,B65,C26,C28,C3,C77
`Chr1:48792071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C65
`Chr1:48792108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,D10
`Chr1:48792117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:48792132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:48792144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C36
`Chr1:48792155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C15,C36
`Chr1:48792167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B126,B15,B44,B50,B65,C26,C28,C77
`Chr1:48792171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr1:48792180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C85,D10
`Chr1:48792189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B8,C25,C34,C43,C7
`Chr1:48792196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B114,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792460.1

106 aa

106

DUF8418

PF28509 DUF8418 1-35 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792460.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	1	35	3.4e-13	49.8	Domain of unknown function (DUF8418)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936477.1
ATGCAAGACTACTTCTACGAGAATCCGACGTACGGACCAATATTTTTACGACGTCGTTTGCGGATGCAGAAGGAGCTATTCTTGTGCATCGTCGATGCTGTGCAAGGTGAAGATGGTTACTTCCGGATGAGCCATGATGCTGCGGATCGGAACTCTCTCACGCCTTTGCAGAAATGCACGCTGGCTATCCGCCAATTAGTCACCGGCGTTAGTGCGGATACTTTCGACGAGTATCTCAAGGTCGTTGACACGACGAGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009217
ATGCAAGACTACTTCTACGAGAATCCGACGTACGGACCAATATTTTTACGACGTCGTTTGCGGATGCAGAAGGAGCTATTCTTGTGCATCGTCGATGCTGTGCAAGGTGAAGATGGTTACTTCCGGATGAGCCATGATGCTGCGGATCGGAACTCTCTCACGCCTTTGCAGAAATGCACGCTGGCTATCCGCCAATTAGTCACCGGCGTTAGTGCGGATACTTTCGACGAGTATCTCAAGGTCGTTGACACGACGAGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792460.1
MQDYFYENPTYGPIFLRRRLRMQKELFLCIVDAVQGEDGYFRMSHDAADRNSLTPLQKCTLAIRQLVTGVSADTFDEYLKVVDTTRHICLKKLCRAVIRAYDAEYL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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