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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002994`

染色体: Chr01 坐标: 48859269-48862747 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002994`
名称	SmilChr01G002994
描述	axial regulator YABBY 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48859269 - 48862747 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988897`
GeneID	`130988897`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988897`
原始查询	`SmilChr01G002994`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	axial regulator YABBY 5-like
产物	axial regulator YABBY 5-like
Arabidopsis	`AT2G26580` (YAB5) plant-specific transcription factor YABBY family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817199] identity=69.6; qcov=0.908; evalue=9.46e-76; confidence=high
Rice	`Os03g0650000` (OsSh1) - identity=51.5; qcov=0.903; evalue=3.01e-51; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0007275 (multicellular organism development); GO:0010158 (abaxial cell fate specification); GO:0045165 (cell fate commitment)
KEGG	-
Pfam	PF04690 (YABBY); PF09011 (HMG_box_2); PF24868 (YABBY_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988897

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768852.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057768852.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768852.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768852.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48862239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768852.1

209 aa

104

209

YABBY_N

YABBY

HMG_box_2

PF24868 YABBY_N 3-52 aa PF04690 YABBY 96-157 aa PF09011 HMG_box_2 107-150 aa

XP_057768862.1

209 aa

104

209

YABBY_N

YABBY

HMG_box_2

PF24868 YABBY_N 3-52 aa PF04690 YABBY 96-157 aa PF09011 HMG_box_2 107-150 aa

XP_057768871.1

185 aa

185

YABBY_N

YABBY

HMG_box_2

PF24868 YABBY_N 3-52 aa PF04690 YABBY 96-157 aa PF09011 HMG_box_2 107-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768852.1`	Pfam	`PF24868`	YABBY_N	Domain	3	52	7.3e-24	83.8	YABBY, N-terminal
`XP_057768852.1`	Pfam	`PF04690`	YABBY	Domain	96	157	1.7e-37	128.3	YABBY protein, C-terminal
`XP_057768852.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	107	150	0.00014	23.2	HMG-box domain
`XP_057768862.1`	Pfam	`PF24868`	YABBY_N	Domain	3	52	7.3e-24	83.8	YABBY, N-terminal
`XP_057768862.1`	Pfam	`PF04690`	YABBY	Domain	96	157	1.7e-37	128.3	YABBY protein, C-terminal
`XP_057768862.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	107	150	0.00014	23.2	HMG-box domain
`XP_057768871.1`	Pfam	`PF24868`	YABBY_N	Domain	3	52	3.1e-24	85.0	YABBY, N-terminal
`XP_057768871.1`	Pfam	`PF04690`	YABBY	Domain	96	157	2.2e-37	127.9	YABBY protein, C-terminal
`XP_057768871.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	107	150	0.00011	23.5	HMG-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912888.1
GAGGGAAAACCGCCCCCCTCGTCCGCCGAGGATAGCAGAGATAGAGATAACGAAAGAGACCCATTATTTCTTAAAAACAAAAATAAAAATAAATAAAGGAATTGAAGCCACAGTTGTGCTAATGCTGCCAAAAATCCTTTCACCTCATCGAAACCCTAACCCTTAATCCTCAACCCACTATATATCAATCGGACGACGTCGTTTCACTTCCACTTGTATCCACATATCGCACCTTTTACATTCTACCCCACCTTTTACTT...

XM_057912869.1
TTTTATAATTTCACCTCACGCAGGTGGCGGTGGCTGTCTAGAAATCATAAATTTCTTGGATGCTATCATATATATGTGCATATAAATTTGTGTATATAGCATAGCTCAATTTGGACGCAAAGCTATAGACAAAGAGAGGAAAAAGCTTCAGCAAGGAAAATTTATTTTCCCTTATCTCTTGTTTCAGCTAATTATTTGGGTTATTCACTTTTTCTCTTGTTCAGAAATGGATGTGTCCGAGCAATTCCGCTACATCCCTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130988897
ATGGATGTGTCCGAGCAATTCCGCTACATCCCTTGCAACTTCTGCAACATCGTTCTTGCGGTGAGTGTTCCATGCAGCAGTTTGCTTGATGTTGTGACAGTTCGATGCGGCCACTGCAGCAATCTGTGGACTGTGAATATGGCTGCTGCTGCCTTCCCATCGATGCAGCCGCCCTCTTCCTGCCAAGATTTTCAGGCAACTAACAGCAGTACTACTCCAACTGAATACAAGGTTGATCTGAGCTCATCTTCCAAATGGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057768852.1
MDVSEQFRYIPCNFCNIVLAVSVPCSSLLDVVTVRCGHCSNLWTVNMAAAAFPSMQPPSSCQDFQATNSSTTPTEYKVDLSSSSKWNYKTQPSISKKPEPRIVNRPPEKRQRVPSAYNQFIKEEIQRIKANNPEISHREAFSTAAKNWAHFPHIHFGLMLETNSQPKLNEVMSIYLSISRIISCANLASFLQQIIHPQNDKHSLLCFLY

XP_057768862.1
MDVSEQFRYIPCNFCNIVLAVSVPCSSLLDVVTVRCGHCSNLWTVNMAAAAFPSMQPPSSCQDFQATNSSTTPTEYKVDLSSSSKWNYKTQPSISKKPEPRIVNRPPEKRQRVPSAYNQFIKEEIQRIKANNPEISHREAFSTAAKNWAHFPHIHFGLMLETNSQPKLNEVMSIYLSISRIISCANLASFLQQIIHPQNDKHSLLCFLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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