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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003018`

染色体: Chr01 坐标: 49203621-49207123 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003018`
名称	SmilChr01G003018
描述	uncharacterized SmilChr01G003018
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49203621 - 49207123 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989136`
GeneID	`130989136`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989136`
原始查询	`SmilChr01G003018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815559]; symbol=AT2G10950; hit=AT2G10950; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815559]; symbol=AT2G10950; hit=AT2G10950; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G10950` (AT2G10950) BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815559] identity=38.7; qcov=0.943; evalue=2.22e-57; confidence=medium
Rice	`Os05g0510700` - identity=41.5; qcov=0.697; evalue=2.36e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03909 (BSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989136

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769059.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057769066.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769059.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057769059.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057769059.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49204190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:49204224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:49204354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:49205091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B106,B62,B75,D9
`Chr1:49206424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:49206689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:49206695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:49206707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B65
`Chr1:49206710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C5,C82
`Chr1:49206751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B122,B62,D9
`Chr1:49206841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B65,D11
`Chr1:49206862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769059.1

372 aa

186

372

BSD

PF03909 BSD 160-214 aa

XP_057769066.1

370 aa

185

370

BSD

PF03909 BSD 157-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769059.1`	Pfam	`PF03909`	BSD	Domain	160	214	2.3e-06	28.3	BSD domain
`XP_057769066.1`	Pfam	`PF03909`	BSD	Domain	157	212	1.6e-06	28.8	BSD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913083.1
ATTAAAATATTATTATTATTTGGGCCTCGGAAATGTTTAGATAGAAATAGCATAAAGAGATCCACTCACCCAAAGATCTTCGTACAATCGCAACAAAACACAAAAAAGAATTCAATTTTGAGCAGATTCCTCGCTGATATACTTAAACCCTTCAATTCGATCATCATACAGAGCTCAAAATTCAATAGTTATCATGAAAAAATCAATGAATAATCGATAAGGAGAAAAAGTAAAAAATTAAAGAAAAATGTCATCTTGGA...

XM_057913076.1
TAGAAATAGCATAAAGAGATCCACTCACCCAAAGATCTTCGTACAATCGCAACAAAACACAAAAAAGAATTCAATTTTGAGCAGATTCCTCGCTGATATACTTAAACCCTTCAATTCGATCATCATACAGAGCTCAAAATTCAATAGTTATCATGAAAAAATCAATGAATAATCGATAAGGAGAAAAAGTAAAAAATTAAAGAAAAATGTCATCTTGGATCCCTTCACTCTTCAATCCCTTCAACGACGACGACGATAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989136
ATGTCATCTTGGATCCCTTCACTCTTCAATCCCTTCAACGACGACGACGATAATCCAAACCCACCTGAGCATTCCTCACCCCCGAAGAGCCCTTCTGCCGGTGCTAGGGATGATCTCTCAGCCGTGTTCCGCGGCGTCGCCGCCTTTCTTGCGCCTCCTCCAGCGGCGGCTTCTTCTTCTGGGCCCTCTTCTTCATCGGAGACGATCGAGGGGATTAAAAGTGATTTGGCTGAAATTCAGGGCACATTCAGATCAGGGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769059.1
MSSWIPSLFNPFNDDDDNPNPPEHSSPPKSPSAGARDDLSAVFRGVAAFLAPPPAAASSSGPSSSSETIEGIKSDLAEIQGTFRSGLSLISSKITSNLLQLQNQLNDGDGNDDVEREEDDDDDDEDGLGISEEVLDFVLKISRRPELWTDFPLSLPDDGNDFHLSNYQREHAANIDHLVPDFKTLRQKICSQMSKEKFWLIYFILLLPRLNEEDLKLLSTQQVAEARETLLKQLQSKNDEETSGNPVSSDAKDASAETVN...

XP_057769066.1
MSSWIPSLFNPFNDDDDNPNPPEHSSPPKSPSAGARDDLSAVFRGVAAFLAPPPAAASSSGPSSSSETIEGIKSDLAEIQGTFRSGLSLISSKITSNLLQLQNQLNDGDGNDDVEREEDDDDDDEDGLGISEEVLDFVLKISRRPELWTDFPLSLPDDDFHLSNYQREHAANIDHLVPDFKTLRQKICSQMSKEKFWLIYFILLLPRLNEEDLKLLSTQQVAEARETLLKQLQSKNDEETSGNPVSSDAKDASAETVNPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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