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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003030`

染色体: Chr01 坐标: 49350683-49353052 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003030`
名称	SmilChr01G003030
描述	triphosphate tunnel metalloenzyme 3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49350683 - 49353052 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989264`
GeneID	`130989264`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989264`
原始查询	`SmilChr01G003030`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	triphosphate tunnel metalloenzyme 3
产物	triphosphate tunnel metalloenzyme 3
Arabidopsis	`AT2G11890` (AT2G11890) adenylate cyclase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815664] identity=59; qcov=1.04; evalue=1.33e-72; confidence=high
Rice	`Os08g0299200` - identity=40.5; qcov=1.04; evalue=4.02e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01928 (CYTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989264

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057769206.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057769206.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057769206.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769206.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769206.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49351333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C83
`Chr1:49351336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:49351393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,C52,C60,D10
`Chr1:49351429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:49351553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:49351602`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A21,B11,B127,B79,C18,C39,D6
`Chr1:49351660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:49351822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B93,C26,C48
`Chr1:49351835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:49351913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769206.1

201 aa

100

201

CYTH

PF01928 CYTH 2-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769206.1`	Pfam	`PF01928`	CYTH	Domain	2	186	1e-23	84.8	CYTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913223.1
TTTTATTCTACCATCACCCATTTTTTTGTTTTAATAGTAGTATTTTGCATTCGGATGTCAGTTAAATAAGCTTTAAAATGCTTCATACTTTAGAGTAACGTACCAAAATTAAGAGGCTTTAATTGAAATGAAACACGACCGTTTCTCATAAATTGGATTGGTTTAGGTTGAATTTAAATCTCAATTATTCTTAAGCAAAAATGCACACAAAAATCGGCTTTAATTTGAAATGCAGCAATTATTTAAAATTTGAAACAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989264
ATGGAGGTCGAAGTGAAGCTCCGATTGCCCAACAAAGCCGCCCACCAGAAGCTCCTCGCCTCGCTCTCCCCATTCCACACCACCACTCACCACCAGCACAACACCTTCTACGACGGCACGGCCGGCGAGCTGAGCTCCCGGAGAGCCGTCCTCCGCCTTCGCTTCCACGAGGAGCCCGTCCTCCCCAAATGTTTCGTCACCCTCAAGGCCAACGCCGTACTAGCTAACGGCGTCAGCCGCGTCGAGGAGGACGAGGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769206.1
MEVEVKLRLPNKAAHQKLLASLSPFHTTTHHQHNTFYDGTAGELSSRRAVLRLRFHEEPVLPKCFVTLKANAVLANGVSRVEEDEEELDYSIGKACSADPQKLNDADSRVLRRVKEEFGIESYVSLGGFKNVRNVYEWKGVELEIDEVNYEFGDMYEIECESVEPDKVKGMITDFLKENGIEYSDSQMSKFAIFRAGKLPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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