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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003032`

染色体: Chr01 坐标: 49357912-49361275 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003032`
名称	SmilChr01G003032
描述	uncharacterized SmilChr01G003032
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49357912 - 49361275 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989283`
GeneID	`130989283`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989283`
原始查询	`SmilChr01G003032`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0514900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os09g0514900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G46900` (AT2G46900) transcription factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819303] identity=57.1; qcov=0.779; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0514900` - identity=57; qcov=0.756; evalue=0; confidence=high
GO	GO:1990112 (RQC complex)
KEGG	-
Pfam	PF04910 (Tcf25)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989283

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057769223.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769223.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769223.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769223.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769223.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49358274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:49359043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B83
`Chr1:49359919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr1:49360102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:49360136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B9,C21,C82,D6
`Chr1:49360355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B131,B24,D4
`Chr1:49360669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,C20,C44,C55
`Chr1:49360884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:49361038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A22,B134,B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769223.1

635 aa

318

635

Tcf25

PF04910 Tcf25 247-570 aa

XP_057769232.1

634 aa

317

634

Tcf25

PF04910 Tcf25 246-569 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769223.1`	Pfam	`PF04910`	Tcf25	Repeat	247	570	7e-74	249.7	Transcriptional repressor TCF25
`XP_057769232.1`	Pfam	`PF04910`	Tcf25	Repeat	246	569	7e-74	249.7	Transcriptional repressor TCF25

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913240.1
AAAGCTAATTGGGCCATGATGTGGCAGCTCAGCCCATTATCTCAGCTCAGCTCACCTCCTCTAAACACTTCCCCAAAACATCGCCTTCTCCAAACCGACGTAGTCAGCGTCCGCCACTGCTAGCTTAGCTCTTCCAATTGGCGGAAGACTGTTTTAGATGTAAAAAGTTTCGGGATTCAGGGATTCCACCTCCTCAGCTCTGTTGATTGATCGGGATTAGTCAAAAGAAATTGTTTATAGGATTTGCAGGCGGAGCAAAA...

XM_057913249.1
AAAGCTAATTGGGCCATGATGTGGCAGCTCAGCCCATTATCTCAGCTCAGCTCACCTCCTCTAAACACTTCCCCAAAACATCGCCTTCTCCAAACCGACGTAGTCAGCGTCCGCCACTGCTAGCTTAGCTCTTCCAATTGGCGGAAGACTGTTTTAGATGTAAAAAGTTTCGGGATTCAGGGATTCCACCTCCTCAGCTCTGTTGATTGATCGGGATTAGTCAAAAGAAATTGTTTATAGGATTTGCAGGCGGAGCAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989283
ATGTCATCTAGGTTGATGAAAAAGGTGCTTCATGAACAATCAGCGCCACTTCAGGAGCTCGACAGCGATGATGATTCGGATTCGCCCGAATCTTCTGCCCCTGCTCGAAATCTGTTTAGCCTTCTTGAAGATGACGATGATGATATTGGAACCAACAGCCATGAGGCCCATGACGACCAGCAGGAAAAAGGTAAAGATGCTGATGAGACTTCGGATTGTGATATTGCTGGCGACCATCCCTCATCAGAAAGGACTGCCTT...

LOC130989283
ATGTCATCTAGGTTGATGAAAAAGGTGCTTCATGAACAATCAGCGCCACTTCAGGAGCTCGACAGCGATGATGATTCGGATTCGCCCGAATCTTCTGCCCCTGCTCGAAATCTGTTTAGCCTTCTTGAAGATGACGATGATGATATTGGAACCAACAGCCATGAGGCCCATGACGACCAGGAAAAAGGTAAAGATGCTGATGAGACTTCGGATTGTGATATTGCTGGCGACCATCCCTCATCAGAAAGGACTGCCTTTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769223.1
MSSRLMKKVLHEQSAPLQELDSDDDSDSPESSAPARNLFSLLEDDDDDIGTNSHEAHDDQQEKGKDADETSDCDIAGDHPSSERTAFNTVLTRNVKSKKKKKKKKNSNREYSSLVNDSGSSDLKLDNLSLIASSSGHQETSSPAKKKLLNGDGDAKLPRKLSKTSVLEVDPKFLSAENELRRIFGSRVVKSQERNPSPANPRLMRGVRRGNHNLKKTIIISPSQHWPRWDGSLSMELLKTLEGVHYFRYTHSPSYAQAQR...

XP_057769232.1
MSSRLMKKVLHEQSAPLQELDSDDDSDSPESSAPARNLFSLLEDDDDDIGTNSHEAHDDQEKGKDADETSDCDIAGDHPSSERTAFNTVLTRNVKSKKKKKKKKNSNREYSSLVNDSGSSDLKLDNLSLIASSSGHQETSSPAKKKLLNGDGDAKLPRKLSKTSVLEVDPKFLSAENELRRIFGSRVVKSQERNPSPANPRLMRGVRRGNHNLKKTIIISPSQHWPRWDGSLSMELLKTLEGVHYFRYTHSPSYAQAQRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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