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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003046`

染色体: Chr01 坐标: 49443326-49448527 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003046`
名称	SmilChr01G003046
描述	V-type proton ATPase catalytic subunit A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49443326 - 49448527 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989559`
GeneID	`130989559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989559`
原始查询	`SmilChr01G003046`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase catalytic subunit A-like
产物	V-type proton ATPase catalytic subunit A-like
Arabidopsis	`AT1G78900` (VHA-A) vacuolar ATP synthase subunit A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844228] identity=93.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0662000` (PLS1) - identity=92.2; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000325 (plant-type vacuole); GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0033180 (proton-transporting V-type ATPase, V1 domain); GO:0046034 (ATP metabolic process); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00006 (ATP-synt_ab); PF02874 (ATP-synt_ab_N); PF16886 (ATP-synt_ab_Xtn); PF22919 (ATP-synt_VA_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.80000	`XP_057769515.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057769515.1`
3	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.60000	`XP_057769515.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769515.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769515.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49444645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B114,B29,B65,C30
`Chr1:49444836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C15
`Chr1:49445230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C29
`Chr1:49446536`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A13
`Chr1:49446536`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A13
`Chr1:49447648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769515.1

623 aa

312

623

ATP-synt_ab_N

ATP-synt_ab_Xtn

ATP-synt_ab

ATP-synt_VA_C

PF02874 ATP-synt_ab_N 25-85 aa PF16886 ATP-synt_ab_Xtn 127-214 aa PF00006 ATP-synt_ab 232-458 aa PF22919 ATP-synt_VA_C 466-561 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769515.1`	Pfam	`PF02874`	ATP-synt_ab_N	Domain	25	85	1.6e-15	58.1	ATP synthase alpha/beta family, beta-barrel domain
`XP_057769515.1`	Pfam	`PF16886`	ATP-synt_ab_Xtn	Domain	127	214	7e-28	97.0	ATPsynthase alpha/beta subunit barrel-sandwich domain
`XP_057769515.1`	Pfam	`PF00006`	ATP-synt_ab	Domain	232	458	9.9e-75	251.6	ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain
`XP_057769515.1`	Pfam	`PF22919`	ATP-synt_VA_C	Domain	466	561	1.8e-29	102.4	C-terminal domain of V and A type ATP synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913532.1
ACGTGGCGCAATCACATTGGTTGTTCTCTTAAGGCGAAAAAAAGTGAGAAAGCAGAGGATCTATCCCCTTATGAGAAACCAAATCAGTGAGTAACTAGCTCCAGCAGCAACTACCCACATCAATCCGTTCACGTTCTCCTCTCCCTCCTTCCCTCTCTTTCTCTCTCTCCACACACTCGCAAAAATCCAAAATCGGTGCAAGATTTGATCTGAAGACCTCTTCTCGTCGATCATCCCGACCTTGATTCGATCACAAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989559
ATGCCGTCCGTCTACGGAGGTCCGCTCACAACGTTCGAGGATGCTGAGAAGGAGAGCGAGTATGGATACGTTCGCAAGGTATCTGGACCAGTGGTTGTTGCTGATGGAATGGCTGGAGCTGCTATGTATGAGCTAGTTCGTGTTGGACACGACAATCTTATTGGAGAAATTATTCGGTTGGAAGGAGATTCCGCCACAATTCAGGTGTATGAGGAAACAGCTGGACTCATGGTGAATGATCCAGTTCTTCGAACACACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769515.1
MPSVYGGPLTTFEDAEKESEYGYVRKVSGPVVVADGMAGAAMYELVRVGHDNLIGEIIRLEGDSATIQVYEETAGLMVNDPVLRTHKPLSVELGPGILGNIFDGIQRPLRTIAIKSGDVYIPRGVSVPALDKDILWEFQPKKIGEGDLLTGGDLYATVHENSLMQHHVALPPDAMGKITYVAPAGQYSLKDTVLELEFQGVKKQFTMLQTWPVRTPRPVASKLAADTPLLTGQRVLDALFPSVLGGTCAIPGAFGCGKTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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