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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003051`

染色体: Chr01 坐标: 49466757-49476130 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003051`
名称	SmilChr01G003051
描述	uncharacterized SmilChr01G003051
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49466757 - 49476130 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989602`
GeneID	`130989602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989602`
原始查询	`SmilChr01G003051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841466]; symbol=AT1G50440; hit=AT1G50440; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841466]; symbol=AT1G50440; hit=AT1G50440; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G50440` (AT1G50440) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841466] identity=56.9; qcov=1.26; evalue=7.53e-90; confidence=high
Rice	`Os02g0132300` (OsRFPV-6) - identity=52.2; qcov=1.3; evalue=1.56e-86; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057769586.1`
2	Endosome	内体	1.00000	`XP_057769605.1`
3	Endosome membrane	内体膜	1.00000	`XP_057769605.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057769586.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057769605.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49468379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:49468383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:49468812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B51,C16,C44,C55
`Chr1:49469733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,C20,C44,C55
`Chr1:49469804`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	71	A10,A13,A18,A4,A5,A8,B10,B103,B111,B118,B12,B121,B126,B133,B137,B138,B140,B21,B26,B30,B35,B38,B39,B5,B53,B56,B60,B63,B65,B68,B69,B7,B71,B72,B76,B78,B80,B83,B85,B86,B93,B96,B99,C14,C15,C16,C20,C22,C28,C35,C37,C40,C42,C45,C47,C54,C6,C60,C61,C62,C64,C66,C7,C71,C74,C78,C79,C84,C85,D5,D7
`Chr1:49469851`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	67	A16,A19,A20,B102,B104,B107,B108,B11,B120,B122,B127,B131,B135,B14,B23,B26,B27,B3,B33,B35,B36,B38,B45,B46,B51,B57,B62,B64,B70,B73,B79,B81,B89,B9,B90,B92,B94,B99,C1,C10,C12,C13,C15,C16,C18,C2,C21,C23,C29,C30,C31,C32,C36,C39,C51,C63,C64,C66,C67,C68,C72,C86,C9,D3,D4,D6,D8
`Chr1:49469878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769586.1

267 aa

134

267

RINGv

PF12906 RINGv 70-117 aa

XP_057769597.1

267 aa

134

267

RINGv

PF12906 RINGv 70-117 aa

XP_057769605.1

257 aa

128

257

RINGv

PF12906 RINGv 70-117 aa

XP_057769615.1

257 aa

128

257

RINGv

PF12906 RINGv 70-117 aa

XP_057769624.1

208 aa

104

208

RINGv

PF12906 RINGv 70-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769586.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	70	117	5.6e-11	43.1	RING-variant domain
`XP_057769597.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	70	117	5.6e-11	43.1	RING-variant domain
`XP_057769605.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	70	117	5.5e-11	43.2	RING-variant domain
`XP_057769615.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	70	117	5.5e-11	43.2	RING-variant domain
`XP_057769624.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	70	106	6.9e-12	46.0	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090703.1
CAAAATCGTAATTTCCCCCGCCGTCTTGGTCAGGTCTGTCGGGTGACGGACGAATTTTTTTTCCGCAATCACACACACACACACACCTCTCTCTCCTTCTCGACGCTATCGTTTCGTCAGCTACGTCTTCTTCTCTACATTCCAAAACCCTAATTAGTGTTATTGTTTTTCCATCTTCCTATTGAAATCACTCGACTGATTTTGTTGCGGACCGATGCTCGTGTGAGATTCTGCATACTGCTTAAAAATCAGGAAGGAGG...

XM_057913603.1
ATGTCAACGTCGGCAAAATCGTAATTTCCCCCGCCGTCTTGGTCAGGTCTGTCGGGTGACGGACGAATTTTTTTTCCGCAATCACACACACACACACACCTCTCTCTCCTTCTCGACGCTATCGTTTCGTCAGCTACGTCTTCTTCTCTACATTCCAAAACCCTAATTAGTGTTATTGTTTTTCCATCTTCCTATTGAAATCACTCGACTGATTTTGTTGCGGACCGATGCTCGTGTGAGATTCTGCATACTGCTTAAAA...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130989602
ATGCAATTAGTAAAGCATGATATTCGGGCAGAGGATTCATCAGAAACAGAGCCCATTTTATCACAGCCTAGTATAGCAGAAAGATTAGAAGAATCTTCTTCCTCAATTGAAATAACTGTGGGTGTGGAATCTTCTGTAGCTTCTGAGCATCCATCAGTTCCCGAAATTGATGAGAGTATTTCTCTAGTTTGCACAGACCAACCGCAGTGCCGCATCTGCCTTGATGCTGAAGGAGAAGATTTAATAGCTCCATGCCATTG...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057769586.1
MQLVKHDIRAEDSSETEPILSQPSIAERLEESSSSIEITVGVESSVASEHPSVPEIDESISLVCTDQPQCRICLDAEGEDLIAPCHCKGTQKYVHRSCLDNWRSTKEGFAFAHCTECRAKFILRANVPPDRWWLRLKFQFLVARDHAIIFVIVQLVVAFLGVLVYKFYGEELREMFGYEEHPYGFYTMAVLAIVLVGLLYGFFIAIICGQRINERHYHVLAKQELTKVLIVFFCRSYNLRCYYLALVISVCFVFSPVSGV...

XP_057769597.1
MQLVKHDIRAEDSSETEPILSQPSIAERLEESSSSIEITVGVESSVASEHPSVPEIDESISLVCTDQPQCRICLDAEGEDLIAPCHCKGTQKYVHRSCLDNWRSTKEGFAFAHCTECRAKFILRANVPPDRWWLRLKFQFLVARDHAIIFVIVQLVVAFLGVLVYKFYGEELREMFGYEEHPYGFYTMAVLAIVLVGLLYGFFIAIICGQRINERHYHVLAKQELTKVLIVFFCRSYNLRCYYLALVISVCFVFSPVSGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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