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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003057`

染色体: Chr01 坐标: 49477247-49478518 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003057`
名称	SmilChr01G003057
描述	uncharacterized SmilChr01G003057
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49477247 - 49478518 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009319`
GeneID	`131009319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009319`
原始查询	`SmilChr01G003057`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=27.5; qcov=0.679; evalue=8.32e-14; confidence=low
Rice	`Os01g0967700` - identity=31.5; qcov=0.346; evalue=2.74e-10; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792604.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792604.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057792604.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792604.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792604.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49477381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:49477389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:49477409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C5
`Chr1:49477411`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A20,B106,B128,B132,B15,B17,B22,B31,B47,B53,B63,C46,C79,D1,D3
`Chr1:49477442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:49477472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B31,C8
`Chr1:49477487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr1:49477489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:49477549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C79,D7
`Chr1:49477566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:49477582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C79,D7
`Chr1:49477636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B140,C79,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792604.1

321 aa

160

321

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 49-116 aa PF13456 RVT_3 182-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792604.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	49	116	1.9e-09	38.7	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057792604.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	182	304	3.7e-19	69.6	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936621.1
ATGAATCAATCGATGAGTGGGTGGAATGTGGATTTGCTCAAGAGCATTGTTGATGAGGCTGATCTTAAGAATATTATGAGTATCCCTCTTCTTCCGAATTTTGGATCAGATAAGATGATTTGGCATTATTCTAATAATGATAGCTACCCTGTCAAGTCCGCCTATAAATTAGCAAGTTCGCTCACTTTGGATACCACCTACAAAGTTGAGGGTCAATGGGAATGTCTCTGGAAAGTTGATGTGCCTCCTAAAGTCAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009319
ATGAATCAATCGATGAGTGGGTGGAATGTGGATTTGCTCAAGAGCATTGTTGATGAGGCTGATCTTAAGAATATTATGAGTATCCCTCTTCTTCCGAATTTTGGATCAGATAAGATGATTTGGCATTATTCTAATAATGATAGCTACCCTGTCAAGTCCGCCTATAAATTAGCAAGTTCGCTCACTTTGGATACCACCTACAAAGTTGAGGGTCAATGGGAATGTCTCTGGAAAGTTGATGTGCCTCCTAAAGTCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792604.1
MNQSMSGWNVDLLKSIVDEADLKNIMSIPLLPNFGSDKMIWHYSNNDSYPVKSAYKLASSLTLDTTYKVEGQWECLWKVDVPPKVKNFLWRAARDNLPSKQRLLSRGVARKAKVCMLLWQIWRDRNAMVWQNEFPVPTRSILRADVARNDWKAMRKPTTQRQRVGASCVGWHSIPEGSFICNVDAAFFEEDQSMGIGVAIRNHEGHFVIGKTIKLNGRRSVVEGELLGIKEALSWIKELGLVTGWVENDSLQACNLITSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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