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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003060`

染色体: Chr01 坐标: 49489348-49493065 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003060`
名称	SmilChr01G003060
描述	kelch repeat-containing protein At3g27220
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49489348 - 49493065 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989694`
GeneID	`130989694`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989694`
原始查询	`SmilChr01G003060`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kelch repeat-containing protein At3g27220
产物	kelch repeat-containing protein At3g27220
Arabidopsis	`AT1G51540` (AT1G51540) Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841579] identity=74.4; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0487100` - identity=74; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01344 (Kelch_1); PF24681 (Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989694

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057769745.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057769745.1`
3	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057769745.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057769745.1`
5	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057769745.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49489645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:49489732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C48,D11
`Chr1:49489748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:49490173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C48,D11
`Chr1:49490214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:49491209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B100,B109,C72,C73
`Chr1:49491331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C57
`Chr1:49492021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C60
`Chr1:49492769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769745.1

421 aa

210

421

Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7

Kelch_1

PF24681 Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7 151-342 aa PF01344 Kelch_1 157-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769745.1`	Pfam	`PF24681`	Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7	Repeat	151	342	9.7e-38	130.4	KLHDC2/KLHL20/DRC7 Kelch-repeats domain
`XP_057769745.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	157	203	1.6e-17	63.4	Kelch motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913762.1
ATAGAAATTTCATTACCTTAAACATGGGATTAACATATTTTCTCCGTATCTGAACGACTGAACCACCGTCAAGACTTTTTTTTTTTTAATAGTTTTTTAATTGTATAATTCATAGCAGCTGCACAACCGCCATTACTGATTTTTCTCTCTCCTCTTCTCCTGAATTCATCACAACACTAACTGAGTCTAAATCAGAAAGGGGAAGGAGCAATGCTTGAATGCTGAAAGATGGCAAGAGCAGCAGCTGCGGGCAAGCACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989694
ATGGCAAGAGCAGCAGCTGCGGGCAAGCACAAAACGACCAAGTTGGTTTTCGTATTGGTGGGGTTATTGGGCCTTTTTCTCATTGTAGATCTGCTATGGGCTTCATCCTCTTCACCTTCTTCCAATTGGATTGTGCCAGATTCCGCCAATATCGTCGTTCCCCAACCTGTTCGCCCCAATAATTCCACTCCGATTAAGGAAAAGCATAAGCAAGACAAGAAGGATGCTGTCTCTGGGAGGGTTTTATCAGCAACTTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769745.1
MARAAAAGKHKTTKLVFVLVGLLGLFLIVDLLWASSSSPSSNWIVPDSANIVVPQPVRPNNSTPIKEKHKQDKKDAVSGRVLSATFADLDAPELKWEKMATAPVPRLDGAAIQIKNLLYVFAGYGTIDYVHSHVDIYNFTDNTWGGRFDMPKEMAHSHLGMVTDGRYIYVVTGQYGPQCRGPTAHTFVLDTETKQWQDMPPLPVPRYAPATQLWRGRLHVMGGSKEDRGTPGVEHWSIAVKDGKVLEKEWRTEIPIPRGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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