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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003074`

染色体: Chr01 坐标: 49579840-49584264 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003074`
名称	SmilChr01G003074
描述	metal tolerance protein C4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49579840 - 49584264 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989787`
GeneID	`130989787`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989787`
原始查询	`SmilChr01G003074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metal tolerance protein C4
产物	metal tolerance protein C4
Arabidopsis	`AT1G51610` (AT1G51610) Cation efflux family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841586] identity=81.8; qcov=0.793; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0298200` (OsMTP7) - identity=83.2; qcov=0.803; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006829 (zinc ion transport); GO:0008324 (monoatomic cation transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01545 (Cation_efflux)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989787

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057769872.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057769872.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057769872.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769872.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769872.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49580257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:49580325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:49580462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:49581796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B60,C60,C71
`Chr1:49581958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B32,B66,C60
`Chr1:49582169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C62
`Chr1:49582676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B60
`Chr1:49583767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B60
`Chr1:49583973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B98,C48,C53
`Chr1:49584021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B98,C48,C53
`Chr1:49584037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:49584049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769872.1

458 aa

229

458

Cation_efflux

PF01545 Cation_efflux 117-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769872.1`	Pfam	`PF01545`	Cation_efflux	Domain	117	325	9.3e-31	107.9	Cation efflux transmembrane domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913889.1
ATTATTTCTAACAATTATACTACTCACGTACTACATATTGAACAAAATAAAAATAAACAAGATTTTTAATAAGCATGATTTATAAGTCTAATTATATAGCACACATTTTTTTAAGTAGATTTTTGAAGCGTATATATGCCCACAATTTTATAGTGCAATTAAACACTACCAATTTTACTCAGCTGAGAGAGAGTAGTGACTGAAGAATATGCTTTTCCTCCACAACTCCTCCGCCGCCCGCCGCCGGTAAACGTCTGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989787
ATGCGATCGTCTCTTCTTCTCTCTCGCCTCCGCCATGAACGAAGCCGTCAGTTCCTGTTCCGCTGCACCATTGCTCAGTTTCATGCCCCTCTCTCGTCGCGCGAGCCGGAAAAGGAACATACTAATTTGCAAGAAAACAAAATTGTTAATTCTGATAATGATTTTTCTTGCCCTCATGGGCGCGCTCAACGGCGGCGTTCAGCCGCAATCTCAAATTTCTTAGCGGCGAATTCTATGCCGAGAGTTGTTCCTCCGTCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769872.1
MRSSLLLSRLRHERSRQFLFRCTIAQFHAPLSSREPEKEHTNLQENKIVNSDNDFSCPHGRAQRRRSAAISNFLAANSMPRVVPPSNSILPFTRSFFTRAKKIEKIASIDHGQRAVTTALWCNFLVFSLKFGVWLSTSSHVMLAEVIHSVADFANQALLAYGLSSSRRAPDALHPYGYSKERFVWSLISAVGIFCLGSGATIVHGVQNLWTAQPPEHIEYAALVIAGSFLIEGASLIVAIHAVRKGAAAEGMKVRDYVWR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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