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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003078`

染色体: Chr01 坐标: 49610645-49613660 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003078`
名称	SmilChr01G003078
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49610645 - 49613660 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989890`
GeneID	`130989890`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989890`
原始查询	`SmilChr01G003078`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=26.9; qcov=0.982; evalue=1.62e-65; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.6; qcov=0.782; evalue=2.15e-67; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989890

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057770030.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057770030.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770030.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770030.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49610852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B121,C17,C28
`Chr1:49610897`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	117	A1,A16,A2,A3,A4,A7,A9,B1,B106,B108,B110,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B129,B13,B130,B132,B134,B136,B137,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B27,B28,B31,B33,B38,B39,B4,B40,B47,B49,B52,B54,B58,B59,B62,B63,B64,B66,B67,B68,B7,B72,B73,B75,B77,B82,B83,B84,B93,B94,B95,B98,C10,C12,C17,C18,C20,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C31,C33,C34,C36,C39,C4,C41,C42,C46,C48,C49,C5,C52,C53,C55,C60,C65,C69,C72,C73,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D9
`Chr1:49610900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C48
`Chr1:49611062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A5,B11,B135,B29,B48,B86,C11,C19,C35,C39,C44,C61,C69,C78,D2,D5
`Chr1:49611090`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	B129,B132,B14,B18,B19,B2,B4,B52,B54,B58,B71,B90,B92,B93,C22,C26,C35,C36,C41,C60,C78,C8,C87
`Chr1:49611096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B44,B79,C43,C71
`Chr1:49611152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:49611222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C18,C25
`Chr1:49611247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B46
`Chr1:49611373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B12,B53,B7,C62
`Chr1:49611388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B69,C56,C75
`Chr1:49611618`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770030.1

907 aa

454

907

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 178-344 aa PF23559 WHD_DRP 431-502 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770030.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	178	344	2e-41	142.1	NB-ARC domain
`XP_057770030.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	431	502	4e-15	56.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914047.1
TTTGAACCTAGTCAGAAACCATCAAGATTGGCACCAAAAATACGACTAATTAAGATCGAGTTGCTAGCCATTGTGTTAGTATAAGAAGCTCAATTAAGTCTATCAAATTCTTATCCAAAATTCTCATAATTATACTCTATTTCCCTTCAACTGATATCGATCATGGCAGCCTACGCAGCTTTGGTTTCTCTAATGCATATCATAGACGACATCGAGCGCCATCATTCCCCTCCAATTTCTCTCAGCAAACAACAAGTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989890
ATGGCAGCCTACGCAGCTTTGGTTTCTCTAATGCATATCATAGACGACATCGAGCGCCATCATTCCCCTCCAATTTCTCTCAGCAAACAACAAGTTCAATCTCTCACTGAAAATGTCACGTTCTTGCAGGAGTTTCTCGAAGCTTATATCTCCCCTGTTTCCGACGGCGACGAAGCAGATCCATTGGAGATGCGTATTGCAGATGCAGCTTACGCGGCAGAACACGCCATCGAATCTCATATCGTGGCCAAGATTCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770030.1
MAAYAALVSLMHIIDDIERHHSPPISLSKQQVQSLTENVTFLQEFLEAYISPVSDGDEADPLEMRIADAAYAAEHAIESHIVAKIQLSRSKETICSRFFSCFRGAEDPKTVSPNHDDDEEMNLYQDVQNVIQEMDEIKSLAMQRNTEKVVLHDKRRSFVSAPSSTGKNSSGTVVWSEGVVNGILERLVADQHERQVIPITGMGGIGKTTLAKTVYSKPIIEHRFDIRAWATISQQYNTREILCELVSQATKQYKEQLSER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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