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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003081`

染色体: Chr01 坐标: 49647605-49650002 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003081`
名称	SmilChr01G003081
描述	60S ribosomal protein L7-2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49647605 - 49650002 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989915`
GeneID	`130989915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989915`
原始查询	`SmilChr01G003081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L7-2-like
产物	60S ribosomal protein L7-2-like
Arabidopsis	`AT3G13580` (AT3G13580) Ribosomal protein L30/L7 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820560] identity=82.2; qcov=0.971; evalue=1.04e-147; confidence=high
Rice	`Os04g0605900` (rpl7) - identity=77.5; qcov=1; evalue=4.33e-139; confidence=high
GO	GO:0000463 (maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00327 (Ribosomal_L30); PF08079 (Ribosomal_L30_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989915

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770067.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057770067.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770067.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770067.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770067.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49647842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C37
`Chr1:49647872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:49648098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:49648597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:49648726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C47
`Chr1:49648915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B127,B79,D4,D6
`Chr1:49649023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770067.1

243 aa

122

243

Ribosomal_L30_N

Ribosomal_L30

PF08079 Ribosomal_L30_N 9-79 aa PF00327 Ribosomal_L30 85-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770067.1`	Pfam	`PF08079`	Ribosomal_L30_N	Domain	9	79	2.5e-23	82.9	Ribosomal L30 N-terminal domain
`XP_057770067.1`	Pfam	`PF00327`	Ribosomal_L30	Domain	85	135	4.3e-18	65.6	Ribosomal protein L30p/L7e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914084.1
AAAAATATGAAAGTAAGTGGCCTAAAGTTCATTTGACATATCCTAACTTTACTCTATTGAATTAAAAAAAGAAAAAAAACAAATTAACGGCTACGATTCAAGGGATATTTTCCAGCCGATAGCAGCCGTCGATATTATTATTCTTCAAGCCCTAAAACCCTAATTTCTTACTCCTTTTCTATAAGTCCGCTTCAAATCAGTTTTTGCCTCAGCCGCTCGACAACGCCGCCGCTCTCGAATTACCGGAAAATCTTAATCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989915
ATGGCTGAGAAGGGAGCACAAATTGTTCCGGAGTCTGTTTTGAAGAAACAGAAGAGAGCCGAGGAATGGGCCCTGGTCAAAAAGCAGGAGGTTGCAGCTCTCAAGGAAAAGAAGGCTGCAAACAGGAAGCTGATCTTCAACAGAGCTAAGGACTATGCAAAGGAGTACGCAGCGCAGGAGAGGGAGCTCATTCAGTTGAAGCGTGAGGCGAGGTTGAAAGGAGGATTCTATGTTAACCCGGAAGCGAAGTTGTTGTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770067.1
MAEKGAQIVPESVLKKQKRAEEWALVKKQEVAALKEKKAANRKLIFNRAKDYAKEYAAQERELIQLKREARLKGGFYVNPEAKLLFIIRIRGINAMHPTTKKILQLLRLRQIFNGVFLKVNKATVNMLHRVEPYVTFGYPNLKSVRELIYKRGYGKVNKQRIALTDNSIIEQTLGKHGIICIEDLIHEILTVGPHFKEANNFLWPFQLSAPLGGLQRKRNHYVEGGDAGNREDYINELIRRMN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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