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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003093`

染色体: Chr01 坐标: 49745754-49749308 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003093`
名称	SmilChr01G003093
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49745754 - 49749308 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990012`
GeneID	`130990012`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990012`
原始查询	`SmilChr01G003093`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=26.9; qcov=0.964; evalue=3.56e-68; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.3; qcov=0.82; evalue=6.41e-74; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990012

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770185.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770185.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770185.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770185.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770185.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49746477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,A6
`Chr1:49746672`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B29,B65
`Chr1:49746672`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B29,B65
`Chr1:49746746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	62	A10,A13,A16,A18,A2,A21,A3,A4,A8,B10,B110,B125,B127,B129,B13,B135,B14,B16,B24,B27,B30,B33,B36,B37,B44,B48,B53,B56,B57,B66,B69,B76,B77,B78,B79,B85,B86,B90,B91,B92,B96,C16,C18,C19,C23,C25,C31,C41,C42,C43,C44,C52,C54,C57,C58,C62,C71,C75,D1,D10,D6,D7
`Chr1:49747064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B52,B6
`Chr1:49747094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:49747107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:49747112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B52,B6
`Chr1:49747334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,D11
`Chr1:49747586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr1:49747740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:49747799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770185.1

918 aa

459

918

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 180-345 aa PF23559 WHD_DRP 432-503 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770185.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	180	345	1e-41	143.1	NB-ARC domain
`XP_057770185.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	432	503	1e-16	61.4	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914202.1
ACAAAATAATGCAACTTGGCGACTTGCATATTGTTTTCTAAAGTCGTGTACACATCTACCCACTATTTTGAACCTATTCTGACATTTCCAAGTTGTTTATTTCAACTTCAATTGATTATTTTCAGCTTTCTTTATCTGAGGGAGATTATTTCAACTTTTGTAAGTGGTGTTCTTAGCCACTTAAATCCTATCAAATTCTTACTCAAAATTCTCAAAAATATACTCTGTTTTCCTTGGACTCAGATCAATCATGGCGGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990012
ATGGCGGCATATGCAGCCTTGGGTTCTCTTATGCATATCATACATGACATCGAACATCATCATTCCCCTCCGATTTCTATCAACAAGCAACAAGTTGAATCCCTCACAGAAGATGTTACGTTCTTGCAGAAATTTCTTCAAGGCTATGAATCCCCTGTTGCTGACGGCGATGAAGCAGATCCATTGGAGCTTCGTATTGCAGATGCAGCTTACTTTGCTCAAGACGTTATCGAATCTCACATTGTGGACAAGATTCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770185.1
MAAYAALGSLMHIIHDIEHHHSPPISINKQQVESLTEDVTFLQKFLQGYESPVADGDEADPLELRIADAAYFAQDVIESHIVDKIQLSRSKETKTARFFNWFRAPKNESSQSSADGNHDDEETKLYQDLQQVIEEMDLTKRVAMKIDTGKAQRNVSASPASIRPSYSMEENNAMVSSDDVLRGIMEKLVGGRLDRQVIPIVGMGGIGKTTLARTIYSKPLITEYFDICAWATVSQKYDAKEILYELLLDVNKKKEGLSKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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