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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003099`

染色体: Chr01 坐标: 49797713-49799255 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003099`
名称	SmilChr01G003099
描述	uncharacterized SmilChr01G003099
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49797713 - 49799255 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009406`
GeneID	`131009406`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009406`
原始查询	`SmilChr01G003099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=25.6; qcov=0.794; evalue=1.48e-36; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.4; qcov=0.733; evalue=6.45e-29; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009406

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792705.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792705.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792705.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792705.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49797725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C46
`Chr1:49797831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:49797872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A6
`Chr1:49797872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr1:49797899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A10,B136,B15,C16,C46,D3
`Chr1:49797929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B46,B69
`Chr1:49797945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:49797988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C46
`Chr1:49797989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C46
`Chr1:49798134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B110,B77
`Chr1:49798345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr1:49798458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792705.1

486 aa

243

486

Transposase_mut

MULE

PF00872 Transposase_mut 307-416 aa PF10551 MULE 308-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792705.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	307	416	3.5e-12	46.6	Transposase, Mutator family
`XP_057792705.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	308	402	7.7e-21	75.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936722.1
ATGTTTCCTATTGAGACGGACATTGGAAGAAGTATCCCTACACACGATGATAGTAGGGACGATTCATCGTCGCAGGAGGAGGAAGACGAGTCCGAGTCTTCAGATGAGGAAGAAGAGGCGATACGACGCAGAGAGATATTGGATTCAGTGTCGACTGAACAGGAAGCGTGGAGACAGACAGGGCCTCAGAATTTCACATCGGATGATCAGCCCGATGTCGAGCCTCGTGTTGGAGTTCAGCAGCTTGAGGCACGTGACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009406
ATGTTTCCTATTGAGACGGACATTGGAAGAAGTATCCCTACACACGATGATAGTAGGGACGATTCATCGTCGCAGGAGGAGGAAGACGAGTCCGAGTCTTCAGATGAGGAAGAAGAGGCGATACGACGCAGAGAGATATTGGATTCAGTGTCGACTGAACAGGAAGCGTGGAGACAGACAGGGCCTCAGAATTTCACATCGGATGATCAGCCCGATGTCGAGCCTCGTGTTGGAGTTCAGCAGCTTGAGGCACGTGACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792705.1
MFPIETDIGRSIPTHDDSRDDSSSQEEEDESESSDEEEEAIRRREILDSVSTEQEAWRQTGPQNFTSDDQPDVEPRVGVQQLEARDWGIPVLDFDDAPALGWEDSNVLESGILSVGALFRSKDDLAIAVGLYHMENHVEYAVHRSSTTRLWFVCKHGNGCPFMLRAVQSASIWRVIKVVMDHTCHTDLNRTAPRQIPARVVGRYFARKLVGKGVVLKPKEMMSEMQRLFGIEINYSFALRARNIAIEMTYGDFGNSYQML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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