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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003100`

染色体: Chr01 坐标: 49805545-49809281 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003100`
名称	SmilChr01G003100
描述	cell wall integrity protein scw1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49805545 - 49809281 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990020`
GeneID	`130990020`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990020`
原始查询	`SmilChr01G003100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cell wall integrity protein scw1
产物	cell wall integrity protein scw1
Arabidopsis	`AT3G21215` (AT3G21215) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821675] identity=75.3; qcov=1.01; evalue=8.88e-147; confidence=high
Rice	`Os06g0151200` - identity=29.9; qcov=0.897; evalue=1.27e-33; confidence=low
GO	GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990020

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770208.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770208.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770208.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770208.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49806586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B104
`Chr1:49806593`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12
`Chr1:49806593`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B12
`Chr1:49807574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:49807832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49808652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49808732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49808978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D7
`Chr1:49809030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:49809041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770208.1

339 aa

170

339

RRM_1

PF00076 RRM_1 64-125 aa PF00076 RRM_1 237-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770208.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	64	125	8.7e-17	61.5	RNA recognition motif
`XP_057770208.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	237	298	8.7e-17	61.5	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914225.1
GAGAAATAATTTTGCTCCTTTTCAATCGAGAAACAGAAACCCTTCTACAGTTCTTACCCATTTAATTCCTTTCCTCCCTAAAAATTTCAATCTTGCAAATATTTGCAACTCCAAATCTTCAAATTTGTGCAAATCCTAGCAAGAATCTGAGAACAACAAAAGAATTCCACAATCAAATCGATCTGCCGAAATGGCGGGTACCGGAATTCACCCCTACCACCAGCAATGGCCGCCCGTTCCCGCCCCTCCTCCGGCCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990020
ATGGCGGGTACCGGAATTCACCCCTACCACCAGCAATGGCCGCCCGTTCCCGCCCCTCCTCCGGCCTCCGCCACCGCGCCGCCGCCCCCTCCTCCCCATCCCCACCCCCATCCGCACCCGCACCCTCACCAGCCGCCGGTTCCTATAGACAATTCCGCCTCCCGCCCTTCTAACGACGAGGTGCGTACGATATTTATTTCGGGTTTGCCAGAGGATGTGAAGGAGAGGGAGCTGCAGAATTTGCTGCGGTGGCTGCCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770208.1
MAGTGIHPYHQQWPPVPAPPPASATAPPPPPPHPHPHPHPHPHQPPVPIDNSASRPSNDEVRTIFISGLPEDVKERELQNLLRWLPGYEASQVNFKGEHPMGFALFATAQHAIAAKDALQDMVFDAESKSLLHTEMAKKNLFVKRGIVADSNVYDQSKRMRIGGDYTHTAYSTSPFHPPPAAVWGPHGYMSPAPPHYDPYAGYAVPPVPMPAPAPVPAPSSYVPVQNNKDNPPCNTLFIGNLGESINEEELRGLFSVQPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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