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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003103`

染色体: Chr01 坐标: 49837106-49840176 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003103`
名称	SmilChr01G003103
描述	DNA-dependent metalloprotease WSS1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49837106 - 49840176 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990038`
GeneID	`130990038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990038`
原始查询	`SmilChr01G003103`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-dependent metalloprotease WSS1-like
产物	DNA-dependent metalloprotease WSS1-like
Arabidopsis	`AT1G55915` (AT1G55915) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842042] identity=68.8; qcov=0.745; evalue=1.06e-110; confidence=high
Rice	`Os06g0191200` - identity=54.3; qcov=1.1; evalue=2.5e-121; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00641 (Zn_ribbon_RanBP); PF08325 (WLM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770224.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770224.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770224.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770224.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770224.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49838538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:49839079`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr1:49839079`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr1:49839107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:49839165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,B79,C45
`Chr1:49839204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C57
`Chr1:49839207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,B79,C45
`Chr1:49839259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C62,D11
`Chr1:49839821`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B4,C36
`Chr1:49839821`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr1:49839978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770224.1

318 aa

159

318

WLM

Zn_ribbon_RanBP

PF08325 WLM 8-202 aa PF00641 Zn_ribbon_RanBP 243-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770224.1`	Pfam	`PF08325`	WLM	Domain	8	202	1.6e-60	205.2	WLM domain
`XP_057770224.1`	Pfam	`PF00641`	Zn_ribbon_RanBP	Domain	243	268	1e-08	35.0	Zn-finger in Ran binding protein and others

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914241.1
GGTCTGAGTAAGCATTGTATGCAAAATTGAAAATTTTGAAATATTTCTTGGTGGCTTGCTCAATAAGAAAATCCTATTGGCCACACGTTTTCAATATTTAAATGGAGCAAAATCGATAGTTTATAGACAATTTATCTGAGAGTTCGCGGCGGAATCCAGCGCTGTTTTTGCATTATATTTCTGTGTTTTCCAGTCGTGATTTTCAGTTGCGAATTCATGCTATCCACATGGACTTGAACGATCTTAACAAAGTATGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990038
ATGGACTTGAACGATCTTAACAAAGTATGGGAAATCAAACCTCTAAAGAAGGTTCGTGAAGATGAAGCAAGGGAAATTCTTGAAAGAGTAGCAAAGCAAGTGCAACCTATCATGCGGAAGAGAAAATGGAAAGTGAAGGTCCTCTCTGAATTTTGCCCGCCTAATCCATCTCTTTTAGGGCTAAATATAGGAGGAGGAGCCGAGGTCAAGTTGAGACTACGTAGGCCAAACAATGAGTGGGATTTTTTCCCTTATGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770224.1
MDLNDLNKVWEIKPLKKVREDEAREILERVAKQVQPIMRKRKWKVKVLSEFCPPNPSLLGLNIGGGAEVKLRLRRPNNEWDFFPYDHILDTMLHELCHNEHGPHNADFYNLLDELRKECEELMAKGITGTGQGFDLPGKRLGGYSRQPPLSSLRQQALVAAEKRSRRETLLPHGPIRLGGDSSIKAVLSPVQAAAMAAERRLHDDLWCGSKSSEHEGTSDDARTTGTSVVDPISIQDQKDDPSWQCDMCTLLNQQRALIC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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