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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003110`

染色体: Chr01 坐标: 49912192-49949935 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003110`
名称	SmilChr01G003110
描述	late blight resistance protein R1-A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49912192 - 49949935 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990095`
GeneID	`130990095`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990095`
原始查询	`SmilChr01G003110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late blight resistance protein R1-A-like
产物	late blight resistance protein R1-A-like
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=29.7; qcov=0.703; evalue=1.12e-55; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=39; qcov=0.413; evalue=7.4e-72; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990095

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770287.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057770287.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770287.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770287.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770287.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49912940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49912973`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C3
`Chr1:49912973`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49912976`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C3
`Chr1:49912976`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49912993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C61,C78
`Chr1:49913001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	114	A1,A11,A13,A14,A20,A23,A6,B1,B102,B104,B108,B111,B112,B114,B117,B118,B119,B12,B121,B123,B125,B126,B128,B129,B132,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B22,B28,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B42,B43,B47,B5,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B60,B63,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B78,B80,B84,B86,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B99,C10,C14,C17,C19,C2,C24,C27,C28,C34,C35,C38,C4,C44,C46,C48,C5,C54,C55,C6,C60,C63,C65,C67,C7,C70,C71,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C87,D1,D11,D2,D3,D5,D7
`Chr1:49947228`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B89,D10
`Chr1:49947228`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B89,D10
`Chr1:49947231`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B89,D10
`Chr1:49947231`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B89,D10
`Chr1:49947431`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A13,A22,A9,B136,B138,B31,B54,B58,B6,B73,B88,B89,C11,C18,C43,C49,C51,C69,C80,C9,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770287.1

858 aa

429

858

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 154-320 aa PF23559 WHD_DRP 404-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770287.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	154	320	3.6e-39	134.8	NB-ARC domain
`XP_057770287.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	404	475	6.7e-15	55.6	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914304.1
CGAACCAAACTGACCAAAATTAATCGCTTCGATTCGATTATTCAGTTTTGCTCACCTCTAATCGATAAGGGAGAAAACCAGCCACACAAGGAGAAGAGCTCCACACAAACAAACTTGTTTTAGTGACATTCTTCTTAGTAACCTCAACTATACTTGAGTTACAGATCGATCATGGCAGCTTATGGAGCTCTGCTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGCATCGAGAATCATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990095
ATGATGTCTCGCTTGAAATCATGGACAAGCTCACCAACGGACAACGCAATCTCCAAGTCATCCCTATTGTGGGGATGGGCGGGATTGGAATTTCTTGAAACCTACCGTTCCCCTGTTGCCGATGAAGCAGATCCACTGGAGATGCGCATAGCAGATGCAACTTATGCTGCTGAAGATGTTATTGAGTCCCATATTGTGGACATGATTAAGCTGCATCAATCCACTTCTATTTATCGTATGACAAAAATCTACTCAGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770287.1
MMSRLKSWTSSPTDNAISKSSLLWGWAGLEFLETYRSPVADEADPLEMRIADATYAAEDVIESHIVDMIKLHQSTSIYRMTKIYSGGKASTSVGSNKPHQGLQKVIKNMALVKKEAMKITGVVVEAQLQRSVSASAGFSSRSSIVVGFDDVSLEIMDKLTNGQRNLQVIPIVGMGGIGKTTLAKHVYAQPLIQQHFDICAHATISQNFDTREILCELLSQANKRSKEELSNMSEAELGLALHKYLFRRRFLIVMDDMWSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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