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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003120`

染色体: Chr01 坐标: 50021061-50021720 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003120`
名称	SmilChr01G003120
描述	uncharacterized SmilChr01G003120
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50021061 - 50021720 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009459`
GeneID	`131009459`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009459`
原始查询	`SmilChr01G003120`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=22.2; qcov=0.863; evalue=1.04e-08; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.1; qcov=0.89; evalue=6.32e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009459

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792778.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792778.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057792778.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792778.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792778.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50021077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:50021110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B76,C24,C72
`Chr1:50021113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C61,C76,D8
`Chr1:50021166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B35,C76,C77
`Chr1:50021175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr1:50021178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B44,B90,C21,C81
`Chr1:50021186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:50021191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B90,C21,C81
`Chr1:50021245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B77,C83
`Chr1:50021312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B114,B3,C37,C38
`Chr1:50021333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr1:50021341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792778.1

219 aa

110

219

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 21-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792778.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	21	115	1.7e-17	64.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936795.1
ATGAATCTTTGTGCATGTACCAAAGACGGATGGACATGGAGAGGCGAATCCGGGAAAGGTTTTACAGCTAAGTCCGTGTATGAAGTTCTTAAAGAGCGAGCAAAGGAGACAACAGAGGTGGTGGAGGAAACAGATATTAGCGCCAAGGTGTGGAAGATACCAATCCCAAACAAAGTCAAGCTTACGGTGTGGAGAATATTGAAGAACAGAATTCCGACGTGCGATAATCTCTTGAGAAGAAACGTAATGTTGAGTGAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009459
ATGAATCTTTGTGCATGTACCAAAGACGGATGGACATGGAGAGGCGAATCCGGGAAAGGTTTTACAGCTAAGTCCGTGTATGAAGTTCTTAAAGAGCGAGCAAAGGAGACAACAGAGGTGGTGGAGGAAACAGATATTAGCGCCAAGGTGTGGAAGATACCAATCCCAAACAAAGTCAAGCTTACGGTGTGGAGAATATTGAAGAACAGAATTCCGACGTGCGATAATCTCTTGAGAAGAAACGTAATGTTGAGTGAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792778.1
MNLCACTKDGWTWRGESGKGFTAKSVYEVLKERAKETTEVVEETDISAKVWKIPIPNKVKLTVWRILKNRIPTCDNLLRRNVMLSEVEVGCNACFYRQESMKHVLLHCPKTSKIWEAIYQWLGVCVVQPHDVPSHFRFFTGLSSRKSNRKFLMALWCCTTWLIWKMRNESRFDNKRWEIASLLGEIKARVWSWGKIFGFVNDGVGMHRWMSSDESPLTL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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