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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003129`

染色体: Chr01 坐标: 50118234-50120985 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003129`
名称	SmilChr01G003129
描述	salviol synthase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50118234 - 50120985 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990203`
GeneID	`130990203`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990203`
原始查询	`SmilChr01G003129`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	salviol synthase-like
产物	salviol synthase-like
Arabidopsis	`AT3G26310` (CYP71B35) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 35 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822235] identity=40.8; qcov=0.992; evalue=1.16e-132; confidence=medium
Rice	`Os02g0184900` - identity=48.2; qcov=0.935; evalue=3.69e-148; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990203

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057770413.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057770413.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770413.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770413.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770413.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50118695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:50119959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:50119997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B25,B33,C10,D5
`Chr1:50120048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:50120131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:50120289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:50120361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr1:50120383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:50120515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B122
`Chr1:50120542`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A11,A18,A2,A5,A6,B104,B106,B111,B117,B124,B126,B127,B16,B44,B45,B53,B62,B85,B97,C10,C13,C18,C24,C43,C47,C48,C59,C7,C70,C71,C76,C79,C83,C87,D4,D9
`Chr1:50120742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:50120780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770413.1

504 aa

252

504

p450

PF00067 p450 39-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770413.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	39	487	2.7e-101	340.3	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914430.1
AAGAAGGAGTTCTTTTATATACGGGTATCAAGTGAGAATAACTATATACATATTTTATGAGAAATATGGTCATTTTTTCTTCTAAACATCTCTCTATATATGAATAACACACAACTTCTTCAACTTAGACACGAGAAATTTATACATTATGGAGTTCAACATCCCATCAACACTCATAGCTCTACTTTCATTTCTCCTCTTTCTCCTCACGTTTCGCAAATCGCGACGAATCTCAAAATTCGCGAACAATTACTCACACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990203
ATGGAGTTCAACATCCCATCAACACTCATAGCTCTACTTTCATTTCTCCTCTTTCTCCTCACGTTTCGCAAATCGCGACGAATCTCAAAATTCGCGAACAATTACTCACACATCCCAGGTCCCAAAACCCTCCCTCTCATCGGAAACCTCCATCTCATGCTACGCGCCACCGTGCCCCACCACATGTTCAGAGACCTCGCCGCCAAACACGGGCCCCTTATGCACCTCCAGCTGGGCGAGATCCACTTCGTCGTCATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770413.1
MEFNIPSTLIALLSFLLFLLTFRKSRRISKFANNYSHIPGPKTLPLIGNLHLMLRATVPHHMFRDLAAKHGPLMHLQLGEIHFVVISSVDFAKQVVRTHDLNFANRPRGLVAETLSYNYTAIVFTPYGDHWRQLRKICTLELLSARRVQSFRHIREEESMNMCEWIASRAGSPANLSEKLFLTSYDIITRAVVGARTAECGTMTSIIEEATQLGAGFMLADLYPSVKWLPLITGARFKIRRMHRKLDKLFSSIVEQHRSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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