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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003130`

染色体: Chr01 坐标: 50127737-50131559 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003130`
名称	SmilChr01G003130
描述	26S proteasome regulatory subunit 7
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50127737 - 50131559 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990212`
GeneID	`130990212`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990212`
原始查询	`SmilChr01G003130`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S proteasome regulatory subunit 7
产物	26S proteasome regulatory subunit 7
Arabidopsis	`AT1G53750` (RPT1A) regulatory particle triple-A 1A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841812] identity=97.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0784700` (OsRpt1b) - identity=97.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0008540 (proteasome regulatory particle, base subcomplex); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0036402 (proteasome-activating activity); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00004 (AAA); PF17862 (AAA_lid_3); PF21236 (OB_PRS7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990212

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770424.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770424.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770424.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770424.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50129465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:50130081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:50130571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr1:50131464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B37,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770424.1

426 aa

213

426

OB_PRS7

AAA

AAA_lid_3

PF21236 OB_PRS7 79-147 aa PF00004 AAA 205-338 aa PF17862 AAA_lid_3 360-403 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770424.1`	Pfam	`PF21236`	OB_PRS7	Domain	79	147	8.1e-40	135.0	26S proteasome regulatory subunit 7, OB domain
`XP_057770424.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	205	338	7.1e-41	140.4	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057770424.1`	Pfam	`PF17862`	AAA_lid_3	Domain	360	403	2.2e-12	47.0	AAA+ lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914441.1
TAAAAATTTCTCACTTCTGCTTCTCCTCCAAGTAAAGTTTCCTCAAAAATCAAATAAATTCCGAAGGAAAAATTGATTGTAATTTGTGAAAATGGCGCACGATCCAGAGGATGAGATCAAGGACGAGAAGAACCCTAAGCCTCTCGATGAAGATGATATCGCCCTCCTCAAAACCTATGGTTTGGGACCTTACTCGAACAGCATAAAGAAAGCTGAGAAGGAAATCAAGGAGATGGCAAAGAAGATCAATGATTTATGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990212
ATGGCGCACGATCCAGAGGATGAGATCAAGGACGAGAAGAACCCTAAGCCTCTCGATGAAGATGATATCGCCCTCCTCAAAACCTATGGTTTGGGACCTTACTCGAACAGCATAAAGAAAGCTGAGAAGGAAATCAAGGAGATGGCAAAGAAGATCAATGATTTATGTGGTATTAAGGAATCGGACACTGGTTTAGCTGCACCAAGTCAGTGGGATCTTGTTTCTGATAAGCAAATGATGCAGGAGGAACAACCTCTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770424.1
MAHDPEDEIKDEKNPKPLDEDDIALLKTYGLGPYSNSIKKAEKEIKEMAKKINDLCGIKESDTGLAAPSQWDLVSDKQMMQEEQPLQVARCTKIINPNTEDAKYVINVKQIAKFVVGLGDKVSPTDIEEGMRVGVDRNKYQIQIPLPPKIDPSVTMMTVEEKPDVTYNDVGGCKEQIEKMREVVELPMLHPEKFVKLGIDPPKGVLCYGPPGTGKTLLARAVANRTDACFIRVIGSELVQKYVGEGARMVRELFQMARSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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