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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003152`

染色体: Chr01 坐标: 50320741-50323708 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003152`
名称	SmilChr01G003152
描述	uncharacterized SmilChr01G003152
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50320741 - 50323708 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990410`
GeneID	`130990410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990410`
原始查询	`SmilChr01G003152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Eukaryotic translation initiation factor 2B (eIF-2B) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841828]; symbol=AT1G53900; hit=AT1G53900; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Eukaryotic translation initiation factor 2B (eIF-2B) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841828]; symbol=AT1G53900; hit=AT1G53900; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G53900` (AT1G53900) Eukaryotic translation initiation factor 2B (eIF-2B) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841828] identity=77.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0497400` - identity=75.3; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity); GO:0005851 (eukaryotic translation initiation factor 2B complex); GO:0006413 (translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF01008 (IF-2B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770630.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770630.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770630.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770630.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770630.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50321086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:50321404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B46,B64,C56
`Chr1:50321444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B24,C58,C75
`Chr1:50322437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B37,C24
`Chr1:50322457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:50322458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B12,B78,B9,C2
`Chr1:50323122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B40
`Chr1:50323277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C33
`Chr1:50323416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770630.1

392 aa

196

392

IF-2B

PF01008 IF-2B 105-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770630.1`	Pfam	`PF01008`	IF-2B	Family	105	380	1.7e-71	241.4	Initiation factor 2 subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914647.1
GTTGTGTATAACTACGAGGGCCTTAAATTTGTGGGATACTTGAGGCGGCCGGCTGGGGCCTCGGCTGCCTCACGGTCCAACCGGCTCTGGTTGATTCGTGCAATTTGAGGACGTGGCGATCATCCATAACTCCATCGTGGCTCTCTACTTGATTGGGTAACCGTAGAGAAGCTAGACCCATATCCGCCCAAACCTCTTTTGTCTCAACCTCGCCGGAATCTCTCCTAACCCCCACCGGCGACGTCGTTTTCACGGTAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990410
ATGTGGTATCGATCAGCTTCTTTCATCCTCGACAAACAGGAGCAGCAGCGCAACGCCGCCGCCGAGAGCCGCCCACTCTCCCCTGCTTCTACCGAGATGGCTGCGGCTGCGGAGAACCCTAGCTCTAACGTCTCAATGTATTACCAGACGCGCGCGGCTCATCACGGCGTCGTAACGAGCGATTGGCTGGCGCAGGCGCAGGCCGCCGTGGCCGGAAATTCCGACGACTGCGTTGCGGTGAACAATGCGTCCAGTGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770630.1
MWYRSASFILDKQEQQRNAAAESRPLSPASTEMAAAAENPSSNVSMYYQTRAAHHGVVTSDWLAQAQAAVAGNSDDCVAVNNASSGEERGKRFSVVDEFNNWRKQPELAEAVAAIRALASVIRSSQAKTMMELEIELKKASDSLKSWDTTSISLTAGCDLFMRYVTRTSALDREDFGSAKSRLLERAEKFGEISYKARRIIAMLSQDFIFDGCTILVHGFSRVVLEALRTAAENKKLFRVLCTEGRPDRSGLRVSNELAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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