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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003158`

染色体: Chr01 坐标: 50414386-50417099 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003158`
名称	SmilChr01G003158
描述	uncharacterized SmilChr01G003158
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50414386 - 50417099 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990468`
GeneID	`130990468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990468`
原始查询	`SmilChr01G003158`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828744]; symbol=AT4G26380; hit=AT4G26380; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828744]; symbol=AT4G26380; hit=AT4G26380; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G26380` (AT4G26380) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828744] identity=27.2; qcov=0.823; evalue=2.17e-36; confidence=low
Rice	`Os07g0610200` - identity=28.3; qcov=0.308; evalue=2.57e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770684.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057770684.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057770684.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770684.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50414624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B25,B78,B98,D10
`Chr1:50414659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A14,A18,B100,B104,B106,B30,B37,B84,B94,C19,D9
`Chr1:50414682`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	64	A13,A14,A2,A21,A5,B1,B100,B103,B119,B120,B124,B125,B126,B129,B134,B137,B140,B15,B2,B20,B27,B35,B37,B44,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B59,B6,B66,B67,B75,B77,B78,B88,B89,B92,C15,C18,C2,C25,C26,C36,C48,C52,C53,C6,C63,C66,C68,C7,C70,C73,C74,C8,C80,C84,C87,D1,D4,D9
`Chr1:50414684`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	65	A13,A14,A2,A21,A5,B1,B100,B103,B119,B120,B124,B125,B126,B129,B134,B137,B140,B15,B2,B20,B27,B35,B37,B44,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B59,B6,B66,B67,B75,B77,B78,B88,B89,B92,C13,C15,C18,C2,C25,C26,C36,C48,C52,C53,C6,C63,C66,C68,C7,C70,C73,C74,C8,C80,C84,C87,D1,D4,D9
`Chr1:50414699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C48,C65
`Chr1:50414705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B25,B78,B98,D10
`Chr1:50414706`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A13,A21,A5,B1,B103,B119,B120,B124,B125,B129,B134,B137,B140,B15,B20,B44,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B6,B75,B88,B89,C15,C18,C2,C25,C52,C53,C56,C63,C66,C68,C7,C70,C73,C74,C8,C84,C87,D1,D4,D9
`Chr1:50414711`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	47	A13,A2,A21,A5,B1,B103,B119,B120,B124,B125,B134,B137,B140,B15,B19,B20,B44,B5,B50,B52,B53,B55,B6,B75,B88,B89,C15,C18,C2,C25,C52,C53,C56,C63,C66,C68,C7,C70,C73,C74,C8,C80,C84,C87,D1,D4,D9
`Chr1:50414742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C14,C74
`Chr1:50414792`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B52,B89
`Chr1:50414792`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B52,B89
`Chr1:50414799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B89,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770684.1

643 aa

322

643

C1_2

PF03107 C1_2 18-65 aa PF03107 C1_2 154-200 aa PF03107 C1_2 211-260 aa PF03107 C1_2 518-564 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770684.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	18	65	5.1e-48	161.9	C1 domain
`XP_057770684.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	154	200	5.1e-48	161.9	C1 domain
`XP_057770684.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	211	260	5.1e-48	161.9	C1 domain
`XP_057770684.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	518	564	5.1e-48	161.9	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914701.1
TACATGGTTTCGGAAAAAAAAAGGTTATAACTAAACATTATAAAGAGACAATTATTTGAGAAAAGCAAAAGCAAAAGCACAAGAGAAAAAGAGAAGAAAAATAAAAGAAAAGGAGATTCTTTGAGTGAAATACTGCTATGATGCATTATTATTTGGTGAGATGGGAAGTTTTGTATGATTCCATTTTATGTGCTAATTAAATGTTAAACTCAAAGCTCCATTGATACAATGAGCTGTAGTTGAGAAGGAAAAAATCACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990468
ATGAGTGAGAAAGAAAATGAGGTAGTTGAGAGAGAGATTGTTGATCATGGGAGCCACGAGCATCCACTTACTTTGGTGGAAACTCGCTTATCTGATAGATGCATTGGTTGTGGTTGGTATTTTAGCAGTGGAGAGAAAGCTTATGGATGTAGCCAGAAATGTGGGGAAGAAATACTATTGCATGAAGAATGTGCAACACTTCCGAGGAAGATTAGACACCCAATGCACCCACAACACATACTCACTCAAACATTCAACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770684.1
MSEKENEVVEREIVDHGSHEHPLTLVETRLSDRCIGCGWYFSSGEKAYGCSQKCGEEILLHEECATLPRKIRHPMHPQHILTQTFNPIASLNLLFAAFFERKLCAICELNVVDRIFYKCRSTECKLWMHMKCAQGSSVMDAGDDEQSGSIINHPSHLRHGLKLVRRSCPFKCDACGVTRRGKSYICCAANCQYWIHERCASLPQTIKREDHHHSLSLSFHVPSLYIKYNFKCDVCTKYLMPKYWIYHCELCSYAVHLNCA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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