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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003159`

染色体: Chr01 坐标: 50417757-50420672 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003159`
名称	SmilChr01G003159
描述	putative FBD-associated F-box protein At5g56690
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50417757 - 50420672 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990473`
GeneID	`130990473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990473`
原始查询	`SmilChr01G003159`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative FBD-associated F-box protein At5g56690
产物	putative FBD-associated F-box protein At5g56690
Arabidopsis	`AT3G28410` (AT3G28410) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822470] identity=22.1; qcov=0.979; evalue=1.59e-09; confidence=weak
Rice	`Os11g0532600` (OsFbox601) - identity=25.5; qcov=0.929; evalue=3.83e-19; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770689.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770689.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770689.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770689.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770689.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50417873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B49,B66
`Chr1:50417921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:50417979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C71
`Chr1:50418094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:50418164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C10
`Chr1:50418177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:50418185`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B11,C10
`Chr1:50418185`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B11,C10
`Chr1:50418580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C54,C56
`Chr1:50418659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:50418660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:50418684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C34,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770689.1

481 aa

240

481

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF00646 F-box 31-66 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 176-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770689.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	31	66	6e-08	33.0	F-box domain
`XP_057770689.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	176	438	1.3e-16	61.7	At1g61320/AtMIF1, LRR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914706.1
GAACGTGTGGGCCCAATTAAAAGTATCCCCAAAAGTATTTAAACCCAAACAGACGAAAAACGAACCCATTGCCTCCCGTACCAGCGATCTGAATCAAAAATTGAAACTCAAAAAAATTCATCAGCCAAATCTTATTAAAATCTATTCCAAATTTAAATTCTGTATCTGCTATCAATTTGATCAGCAGAACTGAGTAACAGACTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTGAGGCAGAGGAACAGACTTTATTGATGGAGCACAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990473
ATGGAGCACAAGGCTCTATCTAGAAAACGAAAGCAAGAGGAGATGGGGATAGATGGTGCTAATAAACAGCATAGGAGTGATAATGGTGGTATTGACAAGTTACCTGATGATGTACTAATCAACATTGTGTCTCACATGAGCTTCAAGGAAGCCGTGAGGGCGAGTGTCCTTGCGCGTCGATGGGGACGTCTGTGGAAGTTTTTCCACGGGACTCTGCGATTTGACGATGGGGATATATCCACCAGATACCTATTGGCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770689.1
MEHKALSRKRKQEEMGIDGANKQHRSDNGGIDKLPDDVLINIVSHMSFKEAVRASVLARRWGRLWKFFHGTLRFDDGDISTRYLLAIKKLESCVNTLNVHEGGHVDGVVVHFNVHLRGVLRGGFYHPTRRALDNLVYFATRKEVQTLEVKLSSHNGYDYDYCEYFFPHVGLLKSHSSFSSLRALRLSRVGVTDELVCYLLASCRSLEELCIRSADLLKNLRVIDPPSLRALEITRCCSIQSLEISAVGLVSLTYGGRKSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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