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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003161`

染色体: Chr01 坐标: 50424449-50427218 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003161`
名称	SmilChr01G003161
描述	uncharacterized SmilChr01G003161
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50424449 - 50427218 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990480`
GeneID	`130990480`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990480`
原始查询	`SmilChr01G003161`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox601; symbol=OsFbox601; hit=Os11g0532600; species=rice; confidence=weak
产物	OsFbox601; symbol=OsFbox601; hit=Os11g0532600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0532600` (OsFbox601) - identity=24.9; qcov=0.974; evalue=6.96e-14; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990480

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770696.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770696.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770696.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770696.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770696.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50424672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:50424682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:50424687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A20,B12,B128,B132,B133,B136,B138,B15,B17,B22,B25,B29,B31,B34,B41,B47,B48,B54,B58,B6,B63,B78,B88,C18,C2,C20,C34,C43,C46,C49,C79,C80,C81,C87,C9,D1,D3,D5
`Chr1:50424705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B121,B32,D11
`Chr1:50424706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C14,C74
`Chr1:50424710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D6
`Chr1:50424736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C10
`Chr1:50424761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B12,B78,C2,C37
`Chr1:50424779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:50424786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:50424797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,C16,C60,C8,D10
`Chr1:50424840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770696.1

421 aa

210

421

LRR_At5g56370

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF24758 LRR_At5g56370 108-178 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 118-368 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770696.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	108	178	3.2e-06	27.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057770696.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	118	368	1.1e-16	61.9	At1g61320/AtMIF1, LRR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914713.1
GAAACCCTCGTACCAGTGCCCAAGTGAACTGAGTCAAAAATTGAAACTAAAAAAATTCATCAGCAAAACTTTTTTAAAATTTATTCGAAATTTAAATTCATCAATTTGATGAGCAGAATTGAGGAACAGTATTTACTGATGGAGCACAAGGCGATATCTAGAAAACGAAAGCAAGAGGAGATGGGAATAGATGGTGCTAATAAAAAGCATAGGAATATTAATGGTGGTATTGACAAGTTACCTAATGATGTACTAATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990480
ATGTGGAAGTTTTTCCACGGGACTCTACGATTTGAAGTTAGGGATATCTCCACCAGAAACCTAATGGGAGTGGAAAAGTTCGAGTCTTGCGTGAATACACTGATGGATCTTCATCAAGGCCGGCATGTTGAGGGCGTTGTCGTTCACGTTGATGTAGTGAGAGGCACGTTCACTGACCAGATGATGTTTGCAGTCGATGATTTGGTGTATTTTGGTACTAGTAAGGAATTTCAAACGCTCGAAGTGAAGCTCTCATCACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770696.1
MWKFFHGTLRFEVRDISTRNLMGVEKFESCVNTLMDLHQGRHVEGVVVHVDVVRGTFTDQMMFAVDDLVYFGTSKEFQTLEVKLSSRNDHDYDYDYGFPSYCEYFFPHVGLLKSHFSFSSLRALSLSHVCVTDDVFCYLLESCHSLEELCIRSASLLMNLRVIDPPSLRALEITRCCSIHSLEISAVGLVSLTYGGRKSRLLLKNIPNVRELALVDESCLYFVREPEKHSSYSPQLEKLVLDIRKLDGRYGRIVAPPDSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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