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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003162`

染色体: Chr01 坐标: 50428198-50431024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003162`
名称	SmilChr01G003162
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50428198 - 50431024 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990485`
GeneID	`130990485`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990485`
原始查询	`SmilChr01G003162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O, chloroplastic
产物	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G74880` (NdhO) NAD(P)H:plastoquinone dehydrogenase complex subunit O [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843827] identity=69.2; qcov=0.881; evalue=5.99e-62; confidence=high
Rice	`Os01g0959900` (P0401G10.21-1) - identity=93.3; qcov=0.596; evalue=6e-59; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0016655 (oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, quinone or similar compound as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF11910 (NdhO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990485

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057770699.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057770699.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057770703.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770699.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770699.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50428356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:50428369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D6
`Chr1:50428370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:50428400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:50429743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B121,B71,C16,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770699.1

177 aa

177

NdhO

PF11910 NdhO 68-141 aa

XP_057770703.1

151 aa

151

NdhO

PF11910 NdhO 68-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770699.1`	Pfam	`PF11910`	NdhO	Family	68	141	3.2e-21	75.8	Cyanobacterial and plant NDH-1 subunit O
`XP_057770703.1`	Pfam	`PF11910`	NdhO	Family	68	141	2.2e-21	76.3	Cyanobacterial and plant NDH-1 subunit O

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914720.1
AATAATCCAAAAAAATCACGTACATGGATAGCAAACCTTATCATATCTTATACGACTCACCTACTCACTGAGAGAAAATATTTTGATGGCGTTGCTCTCTCACGGTTCTTTCTCAGGCACGGCCATCTTCCGCCATGCCGCCATGGCGCCGCCGCGTAGCCTGGCTCGCGTCGTGATAAGATCCGTGCAATCCGCCGAGAATGAGAAGAAGGTTGCTGACACCAAAGAAGAGCAAAAACCTCCTCCAGCTGCTGCTGCTG...

XM_057914716.1
AAAAAAATCACGTACATGGATAGCAAACCTTATCATATCTTATACGACTCACCTACTCACTGAGAGAAAATATTTTGATGGCGTTGCTCTCTCACGGTTCTTTCTCAGGCACGGCCATCTTCCGCCATGCCGCCATGGCGCCGCCGCGTAGCCTGGCTCGCGTCGTGATAAGATCCGTGCAATCCGCCGAGAATGAGAAGAAGGTTGCTGACACCAAAGAAGAGCAAAAACCTCCTCCAGCTGCTGCTGCTGCTAAGCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130990485
ATGGCGTTGCTCTCTCACGGTTCTTTCTCAGGCACGGCCATCTTCCGCCATGCCGCCATGGCGCCGCCGCGTAGCCTGGCTCGCGTCGTGATAAGATCCGTGCAATCCGCCGAGAATGAGAAGAAGGTTGCTGACACCAAAGAAGAGCAAAAACCTCCTCCAGCTGCTGCTGCTGCTAAGCCCAAGAAACCAGTATACTCAATGAAGAAGGGCCAGATCGTAAGAGTCGACAAGGAAAAGTATCTCAATAGTGTAAATTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770699.1
MALLSHGSFSGTAIFRHAAMAPPRSLARVVIRSVQSAENEKKVADTKEEQKPPPAAAAAKPKKPVYSMKKGQIVRVDKEKYLNSVNYLSVGHPPYYKGLDYIYEDRGEVLDLRIFETGEYALIAWVGIPTAPAWLPTEMLIKVTTTNRYDLISLFSEKIKIKIHSGFRNIYELLNSN

XP_057770703.1
MALLSHGSFSGTAIFRHAAMAPPRSLARVVIRSVQSAENEKKVADTKEEQKPPPAAAAAKPKKPVYSMKKGQIVRVDKEKYLNSVNYLSVGHPPYYKGLDYIYEDRGEVLDLRIFETGEYALIAWVGIPTAPAWLPTEMLIKSDKLDYERI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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