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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003173`

染色体: Chr01 坐标: 50541175-50542457 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003173`
名称	SmilChr01G003173
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50541175 - 50542457 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990605`
GeneID	`130990605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990605`
原始查询	`SmilChr01G003173`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
产物	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
Arabidopsis	`AT4G16015` (AT4G16015) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745710] identity=27.3; qcov=0.763; evalue=4.28e-18; confidence=low
Rice	`Os07g0611200` - identity=29.8; qcov=0.613; evalue=2.93e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770814.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057770814.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057770814.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770814.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770814.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50541613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B80,C63,C67
`Chr1:50541636`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B11,B133,B23,B77
`Chr1:50541636`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B11,B133,B23,B77
`Chr1:50541650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:50541657`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B104,B132,B25,B98
`Chr1:50541657`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B104,B132,B25,B98
`Chr1:50541682`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	5	A19,B102,B51,B99,C15
`Chr1:50541682`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A19,B102,B51,B99,C15
`Chr1:50541684`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A20,B109,B110,B133,B23,C12,C18,C34
`Chr1:50541727`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A20,B109,B110,B23,C12,C18,C34,C39
`Chr1:50541731`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A14,A20,B103,B109,B110,B23,B50,B59,B90,C12,C18,C34,C39
`Chr1:50541779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B102,B51,B99,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770814.1

274 aa

137

274

C1_2

PF03107 C1_2 85-136 aa PF03107 C1_2 150-196 aa PF03107 C1_2 219-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770814.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	85	136	9.5e-29	100.2	C1 domain
`XP_057770814.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	150	196	9.5e-29	100.2	C1 domain
`XP_057770814.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	219	260	9.5e-29	100.2	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914831.1
AAAGAACAATGATGAGAAAGGGATTATGGAGTTTCCAATAAGTGACGTGGGTGAGGAGCTAATTGGAGATTTTGTAAAGAGACAATGAGGAGTTATAGCAATACCACTCACCCCTCATCATGACGTCGATTATAAGTTCCACAATCACAAACTTAAATTAGTGTCATCATTATCTTCATCTCAAGAAGAAGAAAATAGTGATGATGATGGAGAAGATAAAAAATCGGAATTAATATGTGATGGGTGCATTACTCCAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990605
ATGAGTTGTAGTAGTGGATGCAATTACAATCTTCACATGGAGTGCTTCCACTTGCCACCTCGCCTCCCCTCCATTCGACTCCACCACCAACCTGGTCACGACCTAATTCTCGAATCTTCTGACAAACTCGGATTTGATTATTGTCACGTGTGTGCCTTCACTTCGAGTGGGTTGTACTATGCTTGTATAGGATGCAAGTTTAAAGCAGACATCAAGTGCACTTCTCTGCCGGACACCATATATCACACAGCTCACCCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770814.1
MSCSSGCNYNLHMECFHLPPRLPSIRLHHQPGHDLILESSDKLGFDYCHVCAFTSSGLYYACIGCKFKADIKCTSLPDTIYHTAHPQHPLNLVSHNDVHQKQRHQYYCGANCGGRSSSFDCYACSSCEFIVHIRCAMLPASFTSCRWDKHHPLPLTYNANLNHPGEFYCDKCEREMNPKSWMYHCRHCDISFHPRCFKTRFGWYSNIRFGKEYVNAAAHPHPLVSQLLTTKRRCNLCRNDRYELPGFHCESCNFFICRDC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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