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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003174`

染色体: Chr01 坐标: 50545763-50553870 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003174`
名称	SmilChr01G003174
描述	ABC transporter B family member 19-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50545763 - 50553870 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990579`
GeneID	`130990579`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990579`
原始查询	`SmilChr01G003174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter B family member 19-like
产物	ABC transporter B family member 19-like
Arabidopsis	`AT3G28860` (ABCB19) ATP binding cassette subfamily B19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822519] identity=43.1; qcov=0.825; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os03g0181750` (OsABCB12) - identity=60.4; qcov=0.641; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	smil02010 (ABC transporters - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF00664 (ABC_membrane); PF09818 (ABC_ATPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990579

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770785.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057770785.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057770785.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770785.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770785.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50546011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B77,B88
`Chr1:50546053`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B60
`Chr1:50546053`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B60
`Chr1:50546056`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B60
`Chr1:50546056`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B60
`Chr1:50546102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B88
`Chr1:50546158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B34
`Chr1:50546160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:50546210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr1:50546231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:50546247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:50546262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770785.1

1506 aa

753

1506

ABC_membrane

ABC_tran

ABC_membrane

ABC_tran

ABC_ATPase

PF00664 ABC_membrane 304-573 aa PF00005 ABC_tran 645-794 aa PF00664 ABC_membrane 937-1206 aa PF00005 ABC_tran 1277-1425 aa PF09818 ABC_ATPase 1372-1475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770785.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	304	573	1.4e-100	337.2	ABC transporter transmembrane region
`XP_057770785.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	645	794	2.5e-65	220.0	ABC transporter
`XP_057770785.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	937	1206	1.4e-100	337.2	ABC transporter transmembrane region
`XP_057770785.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	1277	1425	2.5e-65	220.0	ABC transporter
`XP_057770785.1`	Pfam	`PF09818`	ABC_ATPase	Domain	1372	1475	2.6e-11	43.8	P-loop domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914802.1
TAACTAACAGTAGTGAGAAACAAAAAAAAAAAAAAAAATCTTTGAGCTGAATCCAAAGCACTGCTGCTGGTGTCCCAAAGCTGGAAAAAAAGGGGGCGATTTCTCCAATATTTTCTTGATTGGAATATTCTCATTTAGTTAATCTAATTGCTAAACAACTCCTCAATCATCATCGTCATCTCAACCTTTCTTCCTTGATTCTTCAAGAAAGAAAGAAAAAAGAAATATTCCGTCGAACGAAGATCATGGCTGATCATTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990579
ATGGCTGATCATTCGTTCAAGGCGGAGAATTCGTCGGCCTTCCGCCAAGGGAGGCGGAGGCGGCACACGACTCCGACGAGGTCCGAGTACGTTTCCAACTCCTCATTCTCGACCTCGAGCTCCTACGCCTTCCCCCAGTTCGGGGGGGCCGGGAGGGGGGCCAACCCAACCCCGGCCTCCCCCTTCGCCACCGACGACGACAGGTCGTGGAAGGGGGAGCTCTCGTGGCAGTTTGAGCCGTCCGGGTGGAACGAGAACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770785.1
MADHSFKAENSSAFRQGRRRRHTTPTRSEYVSNSSFSTSSSYAFPQFGGAGRGANPTPASPFATDDDRSWKGELSWQFEPSGWNENHDLGSAMSPWTTNSSTTARSRIFRKSANDYFLSYTYGSGGGGGGGHHSIGNSHQDFSRSGYGLATQQQRLELQSYIARPRAGASTILTSITEGSSGGAHTTVPSVDKHDMDRQIRVIKTYRDLNNQKEQDPRWFSVSHAYMDDKSHHVDDHLESANYSRSRHLGGGGGGAHSVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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