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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003176`

染色体: Chr01 坐标: 50558092-50558520 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003176`
名称	SmilChr01G003176
描述	uncharacterized SmilChr01G003176
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50558092 - 50558520 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009512`
GeneID	`131009512`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009512`
原始查询	`SmilChr01G003176`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818738]; symbol=AT2G41400; hit=AT2G41400; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818738]; symbol=AT2G41400; hit=AT2G41400; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G41400` (AT2G41400) Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818738] identity=40.9; qcov=0.31; evalue=2.19e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30918 (Phylloplanin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009512

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057792883.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792883.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792883.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792883.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792883.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50558146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:50558152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:50558169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C31
`Chr1:50558182`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr1:50558182`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr1:50558186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,A8,B79,D1
`Chr1:50558189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr1:50558372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:50558465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B106,B73
`Chr1:50558476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792883.1

142 aa

142

Phylloplanin

PF30918 Phylloplanin 28-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792883.1`	Pfam	`PF30918`	Phylloplanin	Family	28	109	3.4e-09	37.5	Phylloplanin antifungal protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936900.1
ATGGCCTTTCTCTCACTTCTCATTGCTCTTCTCTCTCTAGGGTTCACACAATCCCCTGCTCAAACAGTGGAAATCAATGTGGTTCTTGCAGGAATTGTCACTTGCACAAATACTTCTATAGCCAACGCAAGAACTTATGCAGTAATCCCACAAGCAAAAGTTGAATTTGTTTGTGGGATTTGGATTTTAGAAAGAGTGATCAAATCAACCACAACAAGCAATGCAGGAATCTACACCTTTGCCTTCGGCCCCAAAGATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009512
ATGGCCTTTCTCTCACTTCTCATTGCTCTTCTCTCTCTAGGGTTCACACAATCCCCTGCTCAAACAGTGGAAATCAATGTGGTTCTTGCAGGAATTGTCACTTGCACAAATACTTCTATAGCCAACGCAAGAACTTATGCAGTAATCCCACAAGCAAAAGTTGAATTTGTTTGTGGGATTTGGATTTTAGAAAGAGTGATCAAATCAACCACAACAAGCAATGCAGGAATCTACACCTTTGCCTTCGGCCCCAAAGATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792883.1
MAFLSLLIALLSLGFTQSPAQTVEINVVLAGIVTCTNTSIANARTYAVIPQAKVEFVCGIWILERVIKSTTTSNAGIYTFAFGPKDILLNNPELCHLRVTFPSSSCSLDPPGGVLRFPIIGIRSSSSLLTEYIAGSPSYLPV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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