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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003190`

染色体: Chr01 坐标: 50639513-50645278 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003190`
名称	SmilChr01G003190
描述	oligouridylate-binding protein 1B-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50639513 - 50645278 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990704`
GeneID	`130990704`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990704`
原始查询	`SmilChr01G003190`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oligouridylate-binding protein 1B-like
产物	oligouridylate-binding protein 1B-like
Arabidopsis	`AT1G17370` (UBP1B) oligouridylate binding protein 1B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838309] identity=82; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0615400` (P0616D06.127-1) - identity=73.1; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990704

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770915.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057770915.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057770915.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770915.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057770920.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50639961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:50639993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B129,B28
`Chr1:50640244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770915.1

421 aa

210

421

RRM_1

PF00076 RRM_1 56-122 aa PF00076 RRM_1 141-211 aa PF00076 RRM_1 260-326 aa

XP_057770920.1

394 aa

197

394

RRM_1

PF00076 RRM_1 29-95 aa PF00076 RRM_1 114-184 aa PF00076 RRM_1 233-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770915.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	56	122	3.7e-47	158.8	RNA recognition motif
`XP_057770915.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	141	211	3.7e-47	158.8	RNA recognition motif
`XP_057770915.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	260	326	3.7e-47	158.8	RNA recognition motif
`XP_057770920.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	29	95	2.7e-47	159.2	RNA recognition motif
`XP_057770920.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	114	184	2.7e-47	159.2	RNA recognition motif
`XP_057770920.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	233	299	2.7e-47	159.2	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914932.1
TTTTTTTGTGAGGCCTCTCTTTCATTCTTCATCTGTCATTTTCTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCTTCTTCTTTATTTTTTATTTTTTAATTTATTTTCGTTTCTTCCCTTTTCCTCTCGCGACAAACCCTACCACTGGAGAAAAAAATTCTAAAAAATTTCTTCGATCATCTCATCCGGATAAAATCATCGGTTACATTTCAATCGAAAATGCTGAATCAAAGA...

XM_057914937.1
GTTTTGAGTTCTTGCTCCAACCTCGTACGCTCCTTGAGTGTTGAGCTTGTGGGTGTACATAATGAACAGCGGGTAGCTATGATGATGTTTGCTTAGAGATGTCAATTTATTGTTGGGGTGAAGGAGAATGGTTGGTGTACAGCAAGCAGTGTCCTCCCCTTAAAGAAATAGAGATTGGTTGCTTACTATCGACACTGTTCATCCTCAGCAGAGAAAGGTGGATGGTAGCGGATGGATAAATTGATCGCAATCTGTATCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130990704
ATGCTGAATCAAAGAATAAAGCAGCAGCAACACCAGGCGTTGATGCAACAAGCTCTCATCCAACAGCAGTCGCTGTATCACCCCGGTCTCTTAGCTGCTCCGCAGATCGAACCAATTCCAAGTGGAAATCTGCCTCCTGGGTTTGATCCAAGTACATGCCGCAGTGTGTATGTGGGGAATATTCACACACAGGTGACTGAACCACTTCTTCAAGAAGTTTTTGCTAGTACAGGTCCTGTGGAGGCTTGCAAGCTTATTAG...

LOC130990704
ATGGATAAATTGATCGCAATCTGTATCGAACCAATTCCAAGTGGAAATCTGCCTCCTGGGTTTGATCCAAGTACATGCCGCAGTGTGTATGTGGGGAATATTCACACACAGGTGACTGAACCACTTCTTCAAGAAGTTTTTGCTAGTACAGGTCCTGTGGAGGCTTGCAAGCTTATTAGAAAAGAAAAGTCATCCTATGGCTTTATACACTACTTTGATCGTAGGTCAGCTTCACTTGCAATATTGACCCTGAATGGGAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770915.1
MLNQRIKQQQHQALMQQALIQQQSLYHPGLLAAPQIEPIPSGNLPPGFDPSTCRSVYVGNIHTQVTEPLLQEVFASTGPVEACKLIRKEKSSYGFIHYFDRRSASLAILTLNGRHLFGQPIKVNWAYASGQREDTSSHYNIFVGDLSPEVTDAMLFACFSVYPSCSDARVMWDQKTGRSRGFGFVSFRNQQDAQSAINDLTGKWLGSRQIRCNWATKGAGTSEDKQNSDSKSVVELTTSEDVKEAAGSDAPENNPQYTTV...

XP_057770920.1
MDKLIAICIEPIPSGNLPPGFDPSTCRSVYVGNIHTQVTEPLLQEVFASTGPVEACKLIRKEKSSYGFIHYFDRRSASLAILTLNGRHLFGQPIKVNWAYASGQREDTSSHYNIFVGDLSPEVTDAMLFACFSVYPSCSDARVMWDQKTGRSRGFGFVSFRNQQDAQSAINDLTGKWLGSRQIRCNWATKGAGTSEDKQNSDSKSVVELTTSEDVKEAAGSDAPENNPQYTTVYVGNLAPEVAQVDLHRHFHALGAGSIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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