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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003193`

染色体: Chr01 坐标: 50684182-50687485 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003193`
名称	SmilChr01G003193
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50684182 - 50687485 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990732`
GeneID	`130990732`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990732`
原始查询	`SmilChr01G003193`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
Arabidopsis	`AT5G19910` (MED31) SOH1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832113] identity=68.8; qcov=1.01; evalue=1.25e-87; confidence=high
Rice	`Os07g0164600` (OsMED31a) - identity=61.9; qcov=1.05; evalue=1.1e-79; confidence=high
GO	GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016592 (mediator complex); GO:0070847 (core mediator complex)
KEGG	-
Pfam	PF05669 (Med31)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990732

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770946.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770954.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770946.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057770954.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057770954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50686618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:50686909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr1:50687169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr1:50687291`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A25,A6,B102,B115,B127,B20,B62,B70,B74,B83,C12,C18,C45,C49,C59
`Chr1:50687337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770946.1

207 aa

104

207

Med31

PF05669 Med31 28-128 aa

XP_057770950.1

206 aa

103

206

Med31

PF05669 Med31 28-127 aa

XP_057770954.1

199 aa

100

199

Med31

PF05669 Med31 28-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770946.1`	Pfam	`PF05669`	Med31	Family	28	128	1.1e-31	109.4	SOH1
`XP_057770950.1`	Pfam	`PF05669`	Med31	Family	28	127	9.3e-32	109.6	SOH1
`XP_057770954.1`	Pfam	`PF05669`	Med31	Family	28	120	1.7e-35	121.6	SOH1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914963.1
AATTACCACACACGCAAAATAGAAAAATTAAAACAGAACAAAAAAGAAAAAGGCAAAAAATGAAGACGACGAGGCTGTATAAGCCCTAACAGATCGACTAGAAGTTCAGCCATGGCGTCCGATCCTATGGAATTAGTAACAAATCATCCGTCGCCGCCCAAAACCGTGTACAAGGATCCAGATGATGGCCGCCAGCGCTTCTTGCTTGAGCTCGAATTTGTCCAGTGCCTTGCTAATCCGACCTATATACATTCAGATAA...

XM_057914967.1
AATTACCACACACGCAAAATAGAAAAATTAAAACAGAACAAAAAAGAAAAAGGCAAAAAATGAAGACGACGAGGCTGTATAAGCCCTAACAGATCGACTAGAAGTTCAGCCATGGCGTCCGATCCTATGGAATTAGTAACAAATCATCCGTCGCCGCCCAAAACCGTGTACAAGGATCCAGATGATGGCCGCCAGCGCTTCTTGCTTGAGCTCGAATTTGTCCAGTGCCTTGCTAATCCGACCTATATACATTATAATGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130990732
ATGGCGTCCGATCCTATGGAATTAGTAACAAATCATCCGTCGCCGCCCAAAACCGTGTACAAGGATCCAGATGATGGCCGCCAGCGCTTCTTGCTTGAGCTCGAATTTGTCCAGTGCCTTGCTAATCCGACCTATATACATTCAGATAATGATTCTTGGAATCTAGATTTAGCTCAAAACAGGTACTTTGAAGATGAGGCGTTTATTGGATACCTGAAATATCTTCAATATTGGCAAAGGCCTGAGTACTTAAAGTTTAT...

LOC130990732
ATGGCGTCCGATCCTATGGAATTAGTAACAAATCATCCGTCGCCGCCCAAAACCGTGTACAAGGATCCAGATGATGGCCGCCAGCGCTTCTTGCTTGAGCTCGAATTTGTCCAGTGCCTTGCTAATCCGACCTATATACATTATAATGATTCTTGGAATCTAGATTTAGCTCAAAACAGGTACTTTGAAGATGAGGCGTTTATTGGATACCTGAAATATCTTCAATATTGGCAAAGGCCTGAGTACTTAAAGTTTATTAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057770946.1
MASDPMELVTNHPSPPKTVYKDPDDGRQRFLLELEFVQCLANPTYIHSDNDSWNLDLAQNRYFEDEAFIGYLKYLQYWQRPEYLKFIMYPHCLFFLELLQNANFRNAMAHPANKELAHRQQFYFWKNYRNNRLKHILPKPLPESSVGANPASAAPPALPPTTIPAAASGIPPAPPQAPSPMQYGMGVGSTFVKNDQRNSGVEKRKRK

XP_057770950.1
MASDPMELVTNHPSPPKTVYKDPDDGRQRFLLELEFVQCLANPTYIHYNDSWNLDLAQNRYFEDEAFIGYLKYLQYWQRPEYLKFIMYPHCLFFLELLQNANFRNAMAHPANKELAHRQQFYFWKNYRNNRLKHILPKPLPESSVGANPASAAPPALPPTTIPAAASGIPPAPPQAPSPMQYGMGVGSTFVKNDQRNSGVEKRKRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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