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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003195`

染色体: Chr01 坐标: 50705893-50707795 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003195`
名称	SmilChr01G003195
描述	protein BIG GRAIN 1-like B
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50705893 - 50707795 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990746`
GeneID	`130990746`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990746`
原始查询	`SmilChr01G003195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BIG GRAIN 1-like B
产物	protein BIG GRAIN 1-like B
Arabidopsis	`AT3G13980` (AT3G13980) SKI/DACH domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820612] identity=41.9; qcov=0.981; evalue=4.76e-58; confidence=medium
Rice	`Os03g0175800` (BG1) - identity=37.9; qcov=0.586; evalue=3.86e-19; confidence=low
GO	GO:0009734 (auxin-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF30505 (Big_grain_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990746

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770960.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057770960.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770960.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770960.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770960.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50706120`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B107
`Chr1:50706120`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B107
`Chr1:50706198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B121,B93
`Chr1:50706446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:50706585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:50706615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C40
`Chr1:50706633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:50706732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C20,C39
`Chr1:50706734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C8
`Chr1:50706797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B54
`Chr1:50706812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C74
`Chr1:50706821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770960.1

423 aa

212

423

Big_grain_1

PF30505 Big_grain_1 123-269 aa PF30505 Big_grain_1 363-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770960.1`	Pfam	`PF30505`	Big_grain_1	Domain	123	269	5.7e-33	115.7	BIG GRAIN 1 auxin transport protein
`XP_057770960.1`	Pfam	`PF30505`	Big_grain_1	Domain	363	414	5.7e-33	115.7	BIG GRAIN 1 auxin transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914977.1
AAATGGAAGATACACTGGCCAGCCCAACTCCAATATAAAGCACTACCATAAGACTGCAAAAAAACTACACAAAACAGAACTCTCTCTCTGTCTCTCTCTAAAATTCTCTCCCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCATAAGCGTGCTTGCAAGCTTTGAGTACAAGCTGCGCCACTCCTTCTCCTTCCCCACATCAAATGAGTGCCCTTGTTTCAACTGTTTTAGCTCAGCACAATATGCACCCCAACTGTGTGTTGTCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990746
ATGGTGGAGAGGTGTGGTTACAGAAGGGAGACCGAAATCTCGCATTTCACCTCCTCGAATTCGAATTATTCATCGTTTTCATCGAGCTTGCTCGATGCGATCTATCGTTCCATCGATCAAGGAGACGACGAGATGGTGATCTATGGCGAAGGAATGAGGAAGAACAGCTGCGGCGCCGAAGGCGCTAACATGCGCCGCGGCGTGTTTAAGAGTGATGAGGAGATGGCGAATTTCCAGCGCGCTTGCATGATCGAGAAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770960.1
MVERCGYRRETEISHFTSSNSNYSSFSSSLLDAIYRSIDQGDDEMVIYGEGMRKNSCGAEGANMRRGVFKSDEEMANFQRACMIEKWMEKKVSEKAVGRRNSVTDFQVKKPRKDRESSSWSSSDSSYAGAAGFFSSSEAESFQVQRPKPIRTGFEKEKSGGNRRELELKPKIEGGFSKTKLRALKIYGDLKKVKQPISPGGKLAGFLNSLFAGGNMKKSKIGDDQSPSLKSTNASTCSSASSFSRSCLSKTPSSRGNHSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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