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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003204`

染色体: Chr01 坐标: 50807252-50810251 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003204`
名称	SmilChr01G003204
描述	PHD finger protein ALFIN-LIKE 4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50807252 - 50810251 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990839`
GeneID	`130990839`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990839`
原始查询	`SmilChr01G003204`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PHD finger protein ALFIN-LIKE 4-like
产物	PHD finger protein ALFIN-LIKE 4-like
Arabidopsis	`AT5G20510` (AL5) alfin-like 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832173] identity=75.1; qcov=0.988; evalue=2.19e-127; confidence=high
Rice	`Os04g0444900` - identity=62; qcov=0.977; evalue=1.84e-113; confidence=high
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0042393 (histone binding)
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD); PF12165 (Alfin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990839

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771057.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057771057.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057771057.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057771057.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50808923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr1:50809454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C40
`Chr1:50809455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B102,B51,C36
`Chr1:50809758`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A18,B10,B103,B138,B31,B54,B58,C18,C46,C49,C51,C80,C87,C9
`Chr1:50809759`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A18,B10,B103,B138,B31,B54,B58,C18,C46,C49,C51,C80,C87,C9
`Chr1:50809840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771057.1

256 aa

128

256

Alfin

PHD

PF12165 Alfin 10-137 aa PF00628 PHD 203-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771057.1`	Pfam	`PF12165`	Alfin	Family	10	137	1.1e-68	229.6	Alfin
`XP_057771057.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	203	249	4.8e-09	36.8	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915074.1
AAAAAACCCTAACAATATTGCAATTATATTTTACGGAATTTAGGAACAAAAAAAAAAATAGGAGGAGTGTTGTTGAGGGTTGTCGGACTCATCATCCAATTCTCAAATATAGTTAAGCCCGTCCAATTTGATTAGATTCAAATCCGCTCCATCATCCCATCTCATTCACTTTTCTCCCTCTCTTTCTCTCTCTCTGGAATTCTTCTATACAATTTATTATCCCCTCCGCCATAAAACCCACACACACATTTTTATTGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990839
ATGGAGGCAACAGGCTACAACCCTCGGACTGTTGAAGAAGTTTTTAGGGATTTTAAGGGCAGAAGAGCTGGACTTATCAAAGCTCTCACTACAGATGTTGAAGAATTTTTCCAGCAGTGCGATCCTGACAAGGAGAATTTGTGCTTGTACGGGTTTCCTGGTGAGCAATGGGAGGTCAATTTACCTGCTGAAGAAGTTCCACCAGAACTCCCTGAGCCTGCTTTAGGAATCAACTTCGCTAGGGATGGGATGCAAGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771057.1
MEATGYNPRTVEEVFRDFKGRRAGLIKALTTDVEEFFQQCDPDKENLCLYGFPGEQWEVNLPAEEVPPELPEPALGINFARDGMQEKDWLSLVAVHSDAWLLAVSFYFGARFGFDKADRKRLFNMINDLPTVFEVVTGAAKKQQKEKSSISNHSSNKFKSNPKPRAETPGKYSRPQPQPKEEDDGLLGLLDEEDEDEHGETLCGACGDNYASDEFWICCDICEKWFHGKCVKITPARAEHIKQYKCPTCNNKRARP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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