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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003205`

染色体: Chr01 坐标: 50811557-50813409 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003205`
名称	SmilChr01G003205
描述	uncharacterized SmilChr01G003205
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50811557 - 50813409 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990860`
GeneID	`130990860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990860`
原始查询	`SmilChr01G003205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843613]; symbol=AT1G72820; hit=AT1G72820; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843613]; symbol=AT1G72820; hit=AT1G72820; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G72820` (AT1G72820) Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843613] identity=74.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0397800` (OSJNBb0058B20.12) - identity=59.1; qcov=0.96; evalue=2.26e-105; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057771074.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057771074.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057771074.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057771074.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771074.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50812017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr1:50812019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B78,C23
`Chr1:50812051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C2
`Chr1:50812326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B33,C71,D10
`Chr1:50812424`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C4
`Chr1:50812424`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C4
`Chr1:50812821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B80,C6,C63,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771074.1

349 aa

174

349

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 38-110 aa PF00153 Mito_carr 126-224 aa PF00153 Mito_carr 255-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771074.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	38	110	1.9e-52	175.7	Mitochondrial carrier protein
`XP_057771074.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	126	224	1.9e-52	175.7	Mitochondrial carrier protein
`XP_057771074.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	255	343	1.9e-52	175.7	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915091.1
CAGGTTTTCTTTTTTTCCCTTAAAATAAAATATTCTGTTCCTATTTTTCTATTGCATTTCTAAAGCTTGTCATCTCTTTCAAAGCCATAAAGAATTGATATTTTTTCCGGCAAGATCCGATCTTACCGGATTTGAAAGGAGAGGAAATGATCGGTAAGAATTTTTAAGAAATGAAGAGCACGTCTATCTTGTTCATTTTCCCATCCAAAACATTCTTCCACAAGCGCAAAAAGTCGATTCACATATCATTATGAATCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990860
ATGAGTCTGAGTGCTGCTGAGGAAGAATCAGCAGGGGAAGAAATCCACATTCCAGCAGATATAGAATGGCAAATGTTGGATAAATCCAAGTTCTTCTTCCTTGGGGCAGCCTTATTCTCCGGTGTCTCGGCTGCATTGTATCCGATGGTGGTGCTAAAAACGCGGCAGCAGGTCTCTCAATCGCGTGTTTCTTGTGTTAGGACTGGGGTTTGGATCATGAGGTATGAAGGGCTTCGCGGATTATATAGGGGATTTGGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771074.1
MSLSAAEEESAGEEIHIPADIEWQMLDKSKFFFLGAALFSGVSAALYPMVVLKTRQQVSQSRVSCVRTGVWIMRYEGLRGLYRGFGTSLTGTIPARALYMTALEVTKSNVGTTATRLGLPEPSAAAVANAAAGLSAAMAAQVVWTPVDVISQRLMTQGSRGGGGGGVSSSHNACKYASGVDAFGKILRADGIRGLYRGFGISILTYAPSNAVWWASYSVTQRVVWSGVGCLLCRNGEEKVENGGLRPDAKAVMAVQGVSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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