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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003208`

染色体: Chr01 坐标: 50862363-50862856 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003208`
名称	SmilChr01G003208
描述	putative lipid-transfer protein DIR1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50862363 - 50862856 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990872`
GeneID	`130990872`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990872`
原始查询	`SmilChr01G003208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative lipid-transfer protein DIR1
产物	putative lipid-transfer protein DIR1
Arabidopsis	`AT5G48490` (AT5G48490) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834905] identity=45.9; qcov=0.98; evalue=2.3e-21; confidence=medium
Rice	`Os07g0287400` (OsLTPd3) - identity=54.7; qcov=0.75; evalue=2.5e-19; confidence=low
GO	GO:0005504 (fatty acid binding); GO:0009627 (systemic acquired resistance)
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990872

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057771083.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057771083.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771083.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771083.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771083.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50862404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C63,C67
`Chr1:50862432`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B68
`Chr1:50862432`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B68
`Chr1:50862522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771083.1

100 aa

100

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 9-99 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 28-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771083.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	9	99	1.5e-11	45.0	Probable lipid transfer
`XP_057771083.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	28	100	1.3e-10	42.0	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915100.1
ATGCATTAATCCAACACAAGGAGCAATATATATTAAATATGGAGTCATCATACAAAAAGGTAGCAATAGTGAGTGTGGTGATGCTGGTGATTCTTGGGGTGGCCGAGGCCCAGACGGTATGCAACATGACGGTGGCGGGGCTGATGGCGTGCAAGCCGTCGGCCACGGCGCCGCATCCACCGCCGCCGTCAGCAGCGTGCTGCTCTGCGCTGTCGGGTGCCGACATGAAGTGCCTATGCTCCTACAAGAACTCCAAGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990872
ATGGAGTCATCATACAAAAAGGTAGCAATAGTGAGTGTGGTGATGCTGGTGATTCTTGGGGTGGCCGAGGCCCAGACGGTATGCAACATGACGGTGGCGGGGCTGATGGCGTGCAAGCCGTCGGCCACGGCGCCGCATCCACCGCCGCCGTCAGCAGCGTGCTGCTCTGCGCTGTCGGGTGCCGACATGAAGTGCCTATGCTCCTACAAGAACTCCAAGGTGCTGCCCTCCCTCGGCATCGACCCCGGCCTCGCCATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771083.1
MESSYKKVAIVSVVMLVILGVAEAQTVCNMTVAGLMACKPSATAPHPPPPSAACCSALSGADMKCLCSYKNSKVLPSLGIDPGLAMQLPQKCQIPHPPKC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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