当前解析结果
SmilChr01G003209| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003209 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003209 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003209 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 50864954 - 50866673 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990878 |
|---|---|
| GeneID | 130990878 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990878 |
| 原始查询 | SmilChr01G003209 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990878 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057771089.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057771089.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771089.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771089.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771089.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:50865400 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | B101,B132,B35,B5,B63,B65,B73,B79,C48,C81,D2,D5 |
Chr1:50865458 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 16 | A11,B100,B102,B112,B40,B67,B72,B85,B9,B95,C12,C16,C29,C66,C74,D3 |
Chr1:50865465 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D11 |
Chr1:50865465 |
G |
GC |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:50866436 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B17,B41,B57,C20,C40,C49,C56 |
Chr1:50866486 |
T |
TCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 56 | A18,B100,B104,B114,B118,B122,B123,B134,B136,B139,B17,B20,B22,B27,B32,B33,B38,B4,B43,B46,B47,B48,B52,B54,B56,B57,B69,B7,B71,B78,B83,B85,B88,B91,B96,B98,B99,C12,C19,C20,C22,C32,C37,C4,C40,C43,C46,C49,C5,C54,C56,C59,C76,C78,D2,D8 |
Chr1:50866510 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 59 | A10,A18,A2,A22,A25,A5,A7,B10,B101,B106,B110,B117,B124,B135,B136,B17,B21,B25,B35,B38,B39,B40,B49,B58,B59,B60,B62,B66,B68,B70,B71,B79,B80,B81,B82,B84,B87,B89,B99,C1,C12,C13,C23,C3,C33,C35,C36,C48,C52,C58,C61,C64,C66,C74,C76,C84,C87,D5,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
10 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。